65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0023 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0023  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000591513  hitchhiker  0.0000000000000043689 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0040  tRNA-Ile  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0036  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000713799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0008  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0034  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2248  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0047  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0021  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126385  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00196  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00202  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00329  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03616  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03720  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2225  tRNA-Met  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.357259  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0019  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572409  normal  0.702119 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0040  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.22275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0044  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796168  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0022    100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.293323 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0005  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0036  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna039  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00772194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna079  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0722838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna157  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0058  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.647177  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0051  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA33  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2800  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000121659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2707  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2075  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00411358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0025  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0259  tRNA-Ile  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1085  tRNA-Ile  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0038  tRNA-Ile  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  100 
 
 		 897 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0074  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.593802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0073  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0085  tRNA-Ile  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0066  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.603715  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0002  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0010  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239466  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAMetVIMSS1309092  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164096  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0022  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0717385  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309107  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.856151  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAMetVIMSS1309166  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.862204  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>