221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0009 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  60  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 91 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 91 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  85.33 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0032  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000491895  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0011  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 87 bp  54  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000337805  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0041  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0833  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1096  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0025  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000078606  normal  0.16194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0033  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0043  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0613926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0897  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4271  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  9.700030000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0027  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000116718  hitchhiker  6.42112e-17 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0036  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.325342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0203  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.829329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00319398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27190  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000521392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna105  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000135439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000379646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0062  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309260  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309375  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.748623  hitchhiker  0.000994808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0078  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000727042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0033  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0044  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00838863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0116  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0194907  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0038  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0038  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0435402  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0026  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0029  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0006  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214474  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0019  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000041967  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0111  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  hitchhiker  0.0000655456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0033  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0106  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112044  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0030  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.924636  hitchhiker  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0043  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.626616  normal  0.0403391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0021  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.690365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0060  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0049  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53957 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309165  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0038  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0662946  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309365  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0030  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742423 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  84 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03508  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  84.51 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  84.51 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA35  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189455  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0135552  hitchhiker  0.000657506 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0014  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0025  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.940611  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0039  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03505  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  84 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0023  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.137885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0032  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0038  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000556956  hitchhiker  0.00693696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0056  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  84 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309071  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309189  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309285  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  84 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309147  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>