More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1112 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1112  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
415 aa  841    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  47.44 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  47.31 
 
 
437 aa  310  4e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  45.32 
 
 
433 aa  306  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  46.73 
 
 
414 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.57 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  41.26 
 
 
421 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  44.27 
 
 
425 aa  297  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  41.65 
 
 
433 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  41.16 
 
 
433 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  42.86 
 
 
436 aa  297  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  44.68 
 
 
413 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  43.61 
 
 
454 aa  296  5e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  44.7 
 
 
421 aa  295  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  41.4 
 
 
433 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  45.68 
 
 
502 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  40.48 
 
 
426 aa  293  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  40.48 
 
 
426 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  40.48 
 
 
426 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  40.48 
 
 
426 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  40.48 
 
 
426 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  40.48 
 
 
426 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  45.6 
 
 
509 aa  292  8e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.64 
 
 
493 aa  292  9e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  40.48 
 
 
426 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  40.48 
 
 
426 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  40.48 
 
 
426 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  40.48 
 
 
426 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  40.48 
 
 
426 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  40.48 
 
 
426 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  44.22 
 
 
422 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  40.48 
 
 
426 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  40.48 
 
 
426 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  41.73 
 
 
433 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  41.73 
 
 
433 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  41.73 
 
 
433 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.17 
 
 
454 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  41.71 
 
 
434 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  39.95 
 
 
489 aa  288  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  41.71 
 
 
435 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  39.95 
 
 
489 aa  288  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  47.15 
 
 
395 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  40.24 
 
 
435 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  39.66 
 
 
429 aa  285  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  40.24 
 
 
426 aa  285  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  45.05 
 
 
435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  37.95 
 
 
419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  37.95 
 
 
419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  39.04 
 
 
432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  45.03 
 
 
441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.01 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  42.75 
 
 
582 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  40.93 
 
 
503 aa  282  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  43.25 
 
 
485 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  38.33 
 
 
419 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  40.62 
 
 
432 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  44.05 
 
 
482 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  45.29 
 
 
441 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  39.65 
 
 
441 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  39.52 
 
 
431 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  39.04 
 
 
429 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  41.69 
 
 
487 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  39.52 
 
 
435 aa  279  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  39.52 
 
 
426 aa  279  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  40.96 
 
 
433 aa  279  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  45.03 
 
 
415 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  44.79 
 
 
493 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  42.13 
 
 
412 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  37.23 
 
 
419 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  42.43 
 
 
442 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  39.61 
 
 
426 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  40.7 
 
 
433 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  36.99 
 
 
419 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  41.75 
 
 
484 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  37.56 
 
 
419 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38.1 
 
 
419 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  38.8 
 
 
429 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  41.94 
 
 
414 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  41.94 
 
 
414 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  40.83 
 
 
431 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  40.15 
 
 
434 aa  278  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  47.37 
 
 
401 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  37.47 
 
 
419 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  38.55 
 
 
435 aa  277  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  41.65 
 
 
444 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4941  GTP-binding protein HflX  41.4 
 
 
433 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  36.99 
 
 
419 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  39.3 
 
 
417 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  38.11 
 
 
441 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  39.61 
 
 
426 aa  276  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  46.07 
 
 
532 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  46.41 
 
 
420 aa  276  6e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  36.75 
 
 
419 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0602  GTP-binding protein HflX  44.69 
 
 
389 aa  275  8e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.406819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0573  GTP-binding protein, HSR1-related  41.16 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  45.94 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  45.94 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  40.14 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  40.79 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  43.67 
 
 
553 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>