More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1020 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1020  LexA family transcriptional regulator  100 
 
 
201 aa  414  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  32.84 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  31.6 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  30.48 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.29 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  29.17 
 
 
261 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  31.28 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  31.55 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  27.4 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  31.28 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  30.73 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  30.05 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  27.65 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  32.79 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.39 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.76 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  29.76 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  29.76 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  29.76 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  29.76 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  29.76 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  29.76 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  29.76 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  27.86 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.86 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  29.81 
 
 
226 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  27.64 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.67 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  29.76 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  29.76 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  27.86 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.42 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  27.86 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  27.86 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  27.86 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  27.86 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  28.84 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  28.14 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  25.69 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  27.36 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.36 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  27.36 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  28.64 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  27.36 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  27.36 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  27.36 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  27.36 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  27.36 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  27.36 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  25.88 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  29.47 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  27.09 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1483  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.4 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.639619  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.11 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  25.34 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.76 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  28.22 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  27.09 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  25.79 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  27.45 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  27.86 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  28.92 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  29.95 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  27.19 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.97 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.43 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2007  LexA repressor  28.08 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.417718  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  27.23 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  27.32 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  27.94 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.94 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.64 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1868  LexA repressor  26.47 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1543  transcriptional repressor, LexA family  26.47 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  28.72 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  27.59 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  24.63 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  27.36 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  27.08 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  27.36 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  27.36 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  25.11 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  25.21 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.31 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.23 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  27.23 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1866  LexA repressor  25.91 
 
 
225 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  27.4 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.04 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  27.08 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  26.27 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.24 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  28.22 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  26.85 
 
 
230 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  27.31 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0386  LexA repressor  28.23 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.86 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  26.85 
 
 
230 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  26.36 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  26.85 
 
 
230 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>