More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0527 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0527  glutamate dehydrogenase  100 
 
 		 450 aa  932    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000275062  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1556  glutamate dehydrogenase  65.39 
 
 		 445 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0818  glutamate dehydrogenase  62.28 
 
 		 447 aa  597  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0942  glutamate dehydrogenase  61.73 
 
 		 466 aa  586  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2051  glutamate dehydrogenase  60.89 
 
 		 451 aa  569  1e-161  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.553496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1647  glutamate dehydrogenase  60.67 
 
 		 451 aa  566  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02515  glutamate dehydrogenase  60.27 
 
 		 447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2214  glutamate dehydrogenase  60.23 
 
 		 438 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.171409  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60710  glutamate dehydrogenase  59.15 
 
 		 445 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5228  glutamate dehydrogenase  58.71 
 
 		 445 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1771  glutamate dehydrogenase  58.56 
 
 		 445 aa  548  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  0.439156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3443  glutamate dehydrogenase  58.84 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4874  glutamate dehydrogenase  58.78 
 
 		 445 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1770  glutamate dehydrogenase  57.43 
 
 		 448 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1499  glutamate dehydrogenase  57.65 
 
 		 448 aa  541  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.981406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0675  glutamate dehydrogenase  57.66 
 
 		 449 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0707  glutamate dehydrogenase  57.66 
 
 		 446 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.469869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0706  glutamate dehydrogenase  57.66 
 
 		 446 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1801  glutamate dehydrogenase  57.85 
 
 		 443 aa  538  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250235  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4509  glutamate dehydrogenase  58.11 
 
 		 446 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0374  glutamate dehydrogenase  60.32 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1459  glutamate dehydrogenase  58.52 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07080  glutamate dehydrogenase  59.42 
 
 		 443 aa  534  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.813 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10490  glutamate dehydrogenase  58.19 
 
 		 451 aa  531  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0193  glutamate dehydrogenase  58.13 
 
 		 449 aa  531  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0573  glutamate dehydrogenase  59.1 
 
 		 448 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5140  glutamate dehydrogenase  58.04 
 
 		 447 aa  534  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1813  glutamate dehydrogenase  56.03 
 
 		 454 aa  534  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0175  glutamate dehydrogenase  57.91 
 
 		 449 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000304056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1186  glutamate dehydrogenase  58.57 
 
 		 450 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3497  glutamate dehydrogenase  58.37 
 
 		 451 aa  528  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4267  glutamate dehydrogenase  55.9 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4353  glutamate dehydrogenase  55.9 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  0.0129009 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3000  glutamate dehydrogenase  58.74 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.741284  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4646  glutamate dehydrogenase  55.9 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1305  glutamate dehydrogenase  57.56 
 
 		 450 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1212  glutamate dehydrogenase  58.48 
 
 		 446 aa  521  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1371  glutamate dehydrogenase  54.87 
 
 		 452 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209216  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0467  glutamate dehydrogenase  58.35 
 
 		 450 aa  523  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000753679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2800  glutamate dehydrogenase  58.31 
 
 		 449 aa  524  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00630068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4804  glutamate dehydrogenase  56.54 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0892  glutamate dehydrogenase  56.03 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0610  glutamate dehydrogenase  57.53 
 
 		 443 aa  518  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0864  glutamate dehydrogenase  58.13 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.342064  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1510  glutamate dehydrogenase  57.43 
 
 		 450 aa  521  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.299473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1895  glutamate dehydrogenase  58.31 
 
 		 450 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0977  glutamate dehydrogenase  56.03 
 
 		 447 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0965022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0060  glutamate dehydrogenase  55.46 
 
 		 449 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.742683  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1152  glutamate dehydrogenase  56.1 
 
 		 449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3219  glutamate dehydrogenase  57.46 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0109  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  58.07 
 
 		 453 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5524  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  55.46 
 
 		 447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148438  normal  0.115697 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2782  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  58.67 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000238369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3019  glutamate dehydrogenase  57.02 
 
 		 449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1457  glutamate dehydrogenase  56.75 
 
 		 448 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1339  glutamate dehydrogenase  56.53 
 
 		 449 aa  514  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.852226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3118  glutamate dehydrogenase  57.46 
 
 		 449 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2123  glutamate dehydrogenase  55.9 
 
 		 449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2125  glutamate dehydrogenase  55.01 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0411981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32600  glutamate dehydrogenase  55.21 
 
 		 447 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4667  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  56 
 
 		 449 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2430  glutamate dehydrogenase  57.56 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2296  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  56.12 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2359  glutamate dehydrogenase  55.9 
 
 		 444 aa  511  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0286  glutamate dehydrogenase  56.54 
 
 		 450 aa  511  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000707094  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1427  glutamate dehydrogenase  56.32 
 
 		 448 aa  512  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0396  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  56.1 
 
 		 447 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34200  glutamate dehydrogenase (NADP)  57.24 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0826  glutamate dehydrogenase  55.96 
 
 		 444 aa  510  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0743965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4852  glutamate dehydrogenase  56.85 
 
 		 444 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  55.56 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1335  glutamate dehydrogenase  57.37 
 
 		 449 aa  504  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.26176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1929  glutamate dehydrogenase  54.34 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000352  NADP-specific glutamate dehydrogenase  57.08 
 
 		 450 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0996  glutamate dehydrogenase  55.75 
 
 		 451 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150602  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2911  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  56.79 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5114  glutamate dehydrogenase  54.91 
 
 		 462 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0629233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1658  glutamate dehydrogenase  56.85 
 
 		 458 aa  504  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0302  glutamate dehydrogenase  55.23 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3724  glutamate dehydrogenase  55.18 
 
 		 447 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1286  glutamate dehydrogenase  56.85 
 
 		 447 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000501948  hitchhiker  0.000436028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0418  glutamate dehydrogenase  54.67 
 
 		 449 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30790  glutamate dehydrogenase  57.4 
 
 		 447 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0726  glutamate dehydrogenase  55.06 
 
 		 446 aa  502  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.830079  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5321  glutamate dehydrogenase  55.46 
 
 		 449 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0346  glutamate dehydrogenase  57.3 
 
 		 445 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1272  glutamate dehydrogenase  56.64 
 
 		 451 aa  498  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3505  glutamate dehydrogenase  56.28 
 
 		 445 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0708  glutamate dehydrogenase  55.13 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3872  glutamate dehydrogenase  55.29 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1330  glutamate dehydrogenase  56.67 
 
 		 453 aa  500  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1219  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  53.16 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1881  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  53.11 
 
 		 447 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.53168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0271  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  56.6 
 
 		 445 aa  495  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1426  glutamate dehydrogenase  53.64 
 
 		 447 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.91122 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2014  glutamate dehydrogenase  53.33 
 
 		 447 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1984  glutamate dehydrogenase  53.33 
 
 		 447 aa  497  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000158842  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2047  glutamate dehydrogenase  53.64 
 
 		 447 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1685  glutamate dehydrogenase  53.42 
 
 		 447 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16151  glutamate dehydrogenase  54.02 
 
 		 451 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.241979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>