225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0483 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0483  hypothetical protein  100 
 
 
589 aa  1165    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.000000147239  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  61.25 
 
 
567 aa  531  1e-149  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  89.79 
 
 
527 aa  523  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  90.71 
 
 
634 aa  522  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0536  hypothetical protein  90.85 
 
 
533 aa  494  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.000617435  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  64.81 
 
 
548 aa  418  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0624  hypothetical protein  69.49 
 
 
686 aa  89  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156919  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.49 
 
 
156 aa  81.3  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.98 
 
 
175 aa  78.6  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.1 
 
 
165 aa  72  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.52 
 
 
151 aa  71.6  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.33 
 
 
171 aa  71.6  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.57 
 
 
147 aa  71.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.32 
 
 
169 aa  69.7  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.96 
 
 
159 aa  69.3  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.56 
 
 
166 aa  69.3  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  52.73 
 
 
165 aa  68.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.24 
 
 
152 aa  69.3  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.69 
 
 
172 aa  68.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.18 
 
 
167 aa  68.6  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  61.67 
 
 
155 aa  68.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.05 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.65 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.1 
 
 
167 aa  66.6  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.67 
 
 
155 aa  65.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.44 
 
 
175 aa  65.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  44.68 
 
 
171 aa  66.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.72 
 
 
156 aa  65.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  43.02 
 
 
163 aa  65.1  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55 
 
 
163 aa  65.1  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  69.77 
 
 
152 aa  64.7  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  59.57 
 
 
171 aa  64.3  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  58.62 
 
 
79 aa  64.3  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.36 
 
 
165 aa  63.9  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.1 
 
 
168 aa  63.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  47.89 
 
 
174 aa  63.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  51.92 
 
 
174 aa  62.4  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.36 
 
 
157 aa  62.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.35 
 
 
169 aa  62.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  71.79 
 
 
158 aa  62.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.78 
 
 
158 aa  62.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.48 
 
 
163 aa  62.4  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.39 
 
 
157 aa  62  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  51.67 
 
 
169 aa  61.6  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  41.98 
 
 
168 aa  60.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.18 
 
 
193 aa  60.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  44.59 
 
 
172 aa  60.5  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  51.72 
 
 
176 aa  59.7  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  52 
 
 
141 aa  60.1  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  65 
 
 
164 aa  60.1  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  67.5 
 
 
48 aa  59.3  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.05 
 
 
163 aa  59.3  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.42 
 
 
142 aa  59.3  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.11 
 
 
157 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54 
 
 
174 aa  58.9  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.3 
 
 
170 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.51 
 
 
167 aa  58.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.23 
 
 
167 aa  58.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  48.08 
 
 
168 aa  58.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  52.73 
 
 
136 aa  58.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  47.46 
 
 
182 aa  57.8  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  39.58 
 
 
169 aa  57.4  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
171 aa  57.4  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.59 
 
 
151 aa  57.4  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  48.33 
 
 
169 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.67 
 
 
154 aa  56.2  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  47.06 
 
 
178 aa  56.2  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  50 
 
 
166 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  52.27 
 
 
169 aa  55.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  45.9 
 
 
172 aa  53.5  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  51.16 
 
 
170 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.02 
 
 
165 aa  52  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  46 
 
 
164 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  34 
 
 
142 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  50 
 
 
182 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  31 
 
 
142 aa  51.6  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.08 
 
 
170 aa  51.6  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  41.54 
 
 
199 aa  50.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  47.54 
 
 
174 aa  50.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  42.25 
 
 
155 aa  50.4  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  45.65 
 
 
161 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  34.69 
 
 
188 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  45.45 
 
 
146 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  47.5 
 
 
172 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  45.24 
 
 
139 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  52.5 
 
 
164 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.02 
 
 
161 aa  49.7  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  52.5 
 
 
136 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.55 
 
 
167 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  46 
 
 
141 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  45.24 
 
 
166 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  47.5 
 
 
172 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  47.5 
 
 
172 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  36 
 
 
153 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  51.28 
 
 
446 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  43.4 
 
 
231 aa  49.3  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  51.28 
 
 
438 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  34.31 
 
 
145 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  45.24 
 
 
179 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  47.5 
 
 
169 aa  48.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>