126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0282 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0282  putative oxidoreductase  100 
 
 		 353 aa  728    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0371  putative oxidoreductase  58.5 
 
 		 356 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3902  putative oxidoreductase  51 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3617  putative oxidoreductase  53.45 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0110465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4200  putative oxidoreductase  51 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4056  putative oxidoreductase  50.71 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5123  putative oxidoreductase  51 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.121383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03573  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  50.71 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.360175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03517  hypothetical protein  50.71 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.394006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0013  putative oxidoreductase  50.43 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0013  putative oxidoreductase  50.43 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  39.83 
 
 		 356 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  27.18 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  25.77 
 
 		 547 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.42 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.88 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  23.73 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  24.53 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 399 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  24.35 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  23.44 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  23.03 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.99 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.99 
 
 		 446 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  23.53 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  24.41 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  23.3 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.95 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.99 
 
 		 446 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  21.8 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  24.12 
 
 		 443 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.12 
 
 		 443 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  23.74 
 
 		 457 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  23.57 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  24.72 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.63 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  23.05 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  24.57 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.03 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  23.64 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  25.26 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  30.18 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.84 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  21.75 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  24.6 
 
 		 409 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.12 
 
 		 468 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  21.99 
 
 		 449 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  22.82 
 
 		 417 aa  49.7  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 398 aa  49.3  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  22.26 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  24.24 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  24.26 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  23.31 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  23.55 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  22.29 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  24.58 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  23.86 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  24.84 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 387 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  21.73 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  21.58 
 
 		 535 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  22.91 
 
 		 529 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  23.31 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  21.41 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  24.44 
 
 		 369 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  25.15 
 
 		 338 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  25.15 
 
 		 338 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.18 
 
 		 622 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>