More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0028 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
875 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
878 aa  646    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
874 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
876 aa  648    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
874 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
863 aa  654    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
881 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
865 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
863 aa  645    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
878 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0028  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
868 aa  1786    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
878 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
859 aa  636    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0223  alanyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
894 aa  634  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0181746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
876 aa  634  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
880 aa  632  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
880 aa  632  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
865 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
880 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
874 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
860 aa  631  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
876 aa  629  1e-178  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
874 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
860 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
879 aa  628  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
874 aa  628  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
892 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
874 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
897 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
874 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
874 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
897 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
890 aa  622  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
876 aa  624  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
876 aa  622  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0877  alanyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 
879 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.438968 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
903 aa  619  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
860 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
882 aa  621  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
897 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
875 aa  619  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
874 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
880 aa  621  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
863 aa  619  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1072  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
845 aa  616  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3176  alanyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
874 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
879 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
875 aa  617  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
874 aa  616  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
874 aa  618  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
876 aa  617  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
884 aa  619  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
872 aa  616  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
875 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
882 aa  616  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
877 aa  617  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
876 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
874 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  40.23 
 
 
876 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
876 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
876 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
879 aa  614  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
890 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
876 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  40.92 
 
 
873 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
874 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 
867 aa  615  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
862 aa  615  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
860 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
870 aa  615  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
876 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
876 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
876 aa  611  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
876 aa  610  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
897 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
876 aa  611  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
874 aa  612  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
879 aa  611  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
879 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
865 aa  612  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
874 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
865 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
874 aa  608  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
879 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
877 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
874 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
897 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
874 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
877 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
875 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
902 aa  608  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
875 aa  605  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
874 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
878 aa  607  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
875 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
897 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
876 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
874 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
900 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>