More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0038 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01560  23S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 2947 bp  2744    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.550873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08390  23S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 2947 bp  2744    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00130  23S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 3022 bp  1251    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02360  23S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 3022 bp  1251    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08950  23S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 3022 bp  1251    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0013  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2969 bp  5886    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0756826  normal  0.599313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0045  23S ribosomal RNA  86.1 
 
 		 2935 bp  955    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.303465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0038  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2969 bp  5886    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.620142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0055  23S ribosomal RNA  99.97 
 
 		 2969 bp  5878    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0373093 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0009  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2961 bp  638  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.609775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  83.71 
 
 		 2958 bp  632  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  83.71 
 
 		 2958 bp  632  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0035  23S ribosomal RNA  82.4 
 
 		 3116 bp  587  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.192227 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0050  23S ribosomal RNA  82.86 
 
 		 2935 bp  555  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SA  23S ribosomal RNA  83.39 
 
 		 2904 bp  549  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SB  23S ribosomal RNA  83.39 
 
 		 2904 bp  549  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0079  23S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 2935 bp  547  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0068  23S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 2935 bp  547  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.502369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0059  23S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 2935 bp  547  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0882856  normal  0.887302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0045  23S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 2976 bp  547  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.570059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0063  23S ribosomal RNA  82.65 
 
 		 2976 bp  539  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0042  23S ribosomal RNA  82.65 
 
 		 2936 bp  539  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000650821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0092  23S ribosomal RNA  82.54 
 
 		 2935 bp  531  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0010  23S ribosomal RNA  82.54 
 
 		 2934 bp  531  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0025  23S ribosomal RNA  81.26 
 
 		 3027 bp  529  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0041  23S ribosomal RNA  81.26 
 
 		 3027 bp  529  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0513089  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0026  23S ribosomal RNA  81.07 
 
 		 3108 bp  521  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0909246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0016  23S ribosomal RNA  81.07 
 
 		 3108 bp  521  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0019  23S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 2875 bp  509  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0049  23S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 2875 bp  509  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.736863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0029  23S ribosomal RNA  81.93 
 
 		 3009 bp  496  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0003  23S ribosomal RNA  81.93 
 
 		 3009 bp  496  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.168115  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12350  23S ribosomal RNA  81.27 
 
 		 3086 bp  468  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102229  normal  0.0554684 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07390  23S ribosomal RNA  81.18 
 
 		 3086 bp  460  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.170063  normal  0.154032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07450  23S ribosomal RNA  81.54 
 
 		 3130 bp  448  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05570  23S ribosomal RNA  81.54 
 
 		 3130 bp  448  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25520  23S ribosomal RNA  81.54 
 
 		 3130 bp  448  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 2932 bp  438  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 2933 bp  438  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 2933 bp  438  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 2933 bp  438  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 2933 bp  438  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 2933 bp  438  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 2933 bp  438  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 2933 bp  438  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 2935 bp  438  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 2933 bp  438  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0028  23S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 3122 bp  432  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0049  23S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 3121 bp  432  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.835565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0006  23S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 3121 bp  432  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0313545  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0066  23S ribosomal RNA  85.34 
 
 		 2921 bp  428  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0039  23S ribosomal RNA  85.34 
 
 		 2921 bp  428  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.409149 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0058  23S ribosomal RNA  85.34 
 
 		 2921 bp  428  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0051  23S ribosomal RNA  85.34 
 
 		 2921 bp  428  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0052  23S ribosomal RNA  81.45 
 
 		 3132 bp  426  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450843  decreased coverage  0.00133177 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2338  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2888 bp  424  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r05  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 3163 bp  424  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r03  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 3163 bp  424  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2337  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2888 bp  424  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.49451  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r02  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 3163 bp  424  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2341  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2888 bp  424  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0034  23S ribosomal RNA  81.45 
 
 		 3132 bp  426  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351192  normal  0.0184688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0067  23S ribosomal RNA  81.45 
 
 		 3132 bp  426  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459802  decreased coverage  0.00789268 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2927 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2927 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2928 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2927 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2927 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0010  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2927 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0035  23S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 2861 bp  422  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.249297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0042  23S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 2861 bp  422  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0050  23S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 2861 bp  422  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2927 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2927 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0008  23S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 2847 bp  420  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0024  23S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 2847 bp  420  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00320172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 2897 bp  420  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 2897 bp  420  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 2897 bp  420  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 2898 bp  420  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 2897 bp  420  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0023  23S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 2997 bp  420  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1462  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 2891 bp  414  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0463  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 2891 bp  414  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.815626  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0520  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 2891 bp  414  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0060  23S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 2918 bp  412  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0005  23S ribosomal RNA  79.96 
 
 		 2885 bp  412  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0053  23S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 2918 bp  412  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0066  23S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 2918 bp  412  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0071  23S ribosomal RNA  79.96 
 
 		 2885 bp  412  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0460512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0005  23S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 2918 bp  412  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4295  23S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 2883 bp  412  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4350  23S ribosomal RNA  84.96 
 
 		 2883 bp  412  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0056  23S ribosomal RNA  79.96 
 
 		 2885 bp  412  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.818984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0019  23S ribosomal RNA  79.96 
 
 		 2885 bp  412  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0039  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 3105 bp  410  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522575  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0047  23S ribosomal RNA  84.64 
 
 		 3105 bp  410  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.137502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0061  23S ribosomal RNA  86.5 
 
 		 2556 bp  412  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0051  23S ribosomal RNA  86.5 
 
 		 2556 bp  412  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0486976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0024  23S ribosomal RNA  86.5 
 
 		 2556 bp  412  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0314547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>