21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0731 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0731  hypothetical protein  100 
 
 
573 aa  1136    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04260  hypothetical protein  56.52 
 
 
480 aa  501  1e-140  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0733  hypothetical protein  33.75 
 
 
350 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.97575  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  25.85 
 
 
345 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  23.08 
 
 
875 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  25.23 
 
 
345 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  23.65 
 
 
861 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  22.71 
 
 
348 aa  50.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  22.08 
 
 
346 aa  50.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  33.03 
 
 
1195 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  27.94 
 
 
339 aa  48.5  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  30.53 
 
 
355 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  44.62 
 
 
773 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  25.29 
 
 
862 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  28.89 
 
 
442 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  21.21 
 
 
247 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  22.87 
 
 
344 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  23.13 
 
 
392 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  39.51 
 
 
362 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  25.94 
 
 
342 aa  44.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2758  hypothetical protein  32.63 
 
 
301 aa  43.5  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>