More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0156 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0156  amino acid permease-associated region  100 
 
 
477 aa  948    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01630  amino acid transporter  62.94 
 
 
483 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.224992  hitchhiker  0.0000000134325 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22350  amino acid transporter  57.38 
 
 
483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.012307  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1383  amino acid permease-associated region  47.7 
 
 
473 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0447  amino acid permease-associated region  47.27 
 
 
473 aa  420  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329261  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2320  amino acid transporter  41.86 
 
 
526 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2316  amino acid transporter  41.13 
 
 
497 aa  352  7e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4896  arginine/ornithine antiporter  41.49 
 
 
471 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.782908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0350  arginine/ornithine antiporter  42.12 
 
 
471 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0474  arginine/ornithine antiporter  41.7 
 
 
471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0422  arginine/ornithine antiporter  41.49 
 
 
471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  41.49 
 
 
471 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  41.7 
 
 
471 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2166  arginine/ornithine antiporter  37.89 
 
 
475 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2247  arginine/ornithine antiporter  38.83 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2713  arginine/ornithine antiporter  40.3 
 
 
476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2657  arginine/ornithine antiporter  40.3 
 
 
476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1392  arginine/ornithine antiporter  37.78 
 
 
496 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.679815 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  37.19 
 
 
472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2423  arginine/ornithine antiporter  37.98 
 
 
489 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06670  arginine/ornithine antiporter  36.63 
 
 
480 aa  296  7e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.477443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4385  arginine/ornithine antiporter  37.67 
 
 
475 aa  289  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1001  arginine/ornithine antiporter  37.5 
 
 
475 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1039  arginine/ornithine antiporter  36.85 
 
 
475 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808656  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2683  arginine/ornithine antiporter  36 
 
 
475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4222  arginine/ornithine antiporter  37.01 
 
 
475 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1002  arginine/ornithine antiporter  36.8 
 
 
475 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2383  arginine/ornithine antiporter  37.61 
 
 
486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.646333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2129  arginine/ornithine antiporter  37.39 
 
 
506 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0916  arginine/ornithine antiporter  37.39 
 
 
486 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1144  arginine/ornithine antiporter  37.39 
 
 
486 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0243  arginine/ornithine antiporter  37.39 
 
 
486 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1969  arginine/ornithine antiporter  37.39 
 
 
486 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1988  arginine/ornithine antiporter  37.39 
 
 
486 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1584  arginine/ornithine antiporter  37.39 
 
 
506 aa  282  9e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  35.7 
 
 
475 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14000  amino acid transporter  35.9 
 
 
495 aa  280  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2127  arginine/ornithine antiporter  35.91 
 
 
475 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2065  arginine/ornithine antiporter  35.91 
 
 
475 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00119125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2061  arginine/ornithine antiporter  35.91 
 
 
475 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.111642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2307  arginine/ornithine antiporter  35.91 
 
 
475 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2391  arginine/ornithine antiporter  35.7 
 
 
471 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2281  arginine/ornithine antiporter  35.91 
 
 
475 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2315  arginine/ornithine antiporter  35.49 
 
 
471 aa  276  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1109  arginine/ornithine antiporter  36.36 
 
 
475 aa  276  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.28189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4384  arginine/ornithine antiporter  36.5 
 
 
475 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.669533  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2264  arginine/ornithine antiporter  35.28 
 
 
475 aa  273  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4536  arginine/ornithine antiporter  35.29 
 
 
484 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3061  arginine/ornithine antiporter  35.28 
 
 
475 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2851  arginine/ornithine antiporter  35.4 
 
 
468 aa  270  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000722534  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1089  arginine/ornithine antiporter  34.95 
 
 
493 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.505428 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19660  amino acid transporter  32.24 
 
 
489 aa  266  7e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.598137  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  34.45 
 
 
475 aa  266  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2970  amino acid permease-associated region  34.84 
 
 
494 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5910  arginine/ornithine antiporter  37.5 
 
 
482 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0569669  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2906  amino acid permease-associated region  33.88 
 
 
500 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68300  arginine/ornithine antiporter  37.28 
 
 
482 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000378428  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  33.26 
 
 
478 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  33.7 
 
 
478 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0744  arginine/ornithine antiporter  33.96 
 
 
503 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1003  arginine/ornithine antiporter  35.5 
 
 
475 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1040  arginine/ornithine antiporter  35.5 
 
 
480 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188854  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4221  arginine/ornithine antiporter  34.42 
 
 
475 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2660  arginine/ornithine antiporter  34.93 
 
 
475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5574  arginine/ornithine antiporter  36.1 
 
 
493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04620  amino acid transporter  35.03 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2315  arginine/ornithine antiporter  33.48 
 
 
460 aa  253  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222235  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01574  predicted arginine/ornithine antiporter transporter  33.48 
 
 
460 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.424719  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1791  arginine/ornithine antiporter  33.56 
 
 
460 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0468427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2038  arginine/ornithine antiporter  33.48 
 
 
460 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000756362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01564  hypothetical protein  33.48 
 
 
460 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.358572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1002  arginine/ornithine antiporter  34.85 
 
 
475 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1680  putative arginine/ornithine antiporter  33.48 
 
 
460 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.982096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1594  arginine/ornithine antiporter  33.48 
 
 
460 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132259  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1813  putative arginine/ornithine antiporter  33.48 
 
 
460 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00102354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2025  arginine/ornithine antiporter  33.48 
 
 
460 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2587  arginine/ornithine antiporter  34.35 
 
 
463 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0653  amino acid permease  34.23 
 
 
483 aa  250  5e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2174  arginine/ornithine antiporter  34.92 
 
 
492 aa  248  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1828  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  34.49 
 
 
463 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.768875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2298  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  34.49 
 
 
463 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.552138 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1939  arginine/ornithine antiporter  34.49 
 
 
463 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1878  arginine/ornithine APC family antiporter  36.12 
 
 
493 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1645  arginine/ornithine antiporter  34.52 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.498381  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1847  arginine/ornithine antiporter  34.84 
 
 
460 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.861199  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1586  arginine/ornithine antiporter  34.52 
 
 
460 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916366  normal  0.560128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1697  arginine/ornithine antiporter  34.52 
 
 
460 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1577  arginine/ornithine antiporter  34.52 
 
 
460 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933609  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1498  amino acid permease-associated region  34.22 
 
 
445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333437  normal  0.389664 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1484  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  34.01 
 
 
496 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0574434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0377  putative arginine/ornithine antiporter  32.78 
 
 
481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2905  arginine/ornithine antiporter  33.33 
 
 
473 aa  234  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0072  amino acid permease  34.01 
 
 
671 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1571  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  34.61 
 
 
663 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0188747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11790  amino acid transporter  32.52 
 
 
472 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122801  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48850  amino acid permease  34.66 
 
 
472 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176582  hitchhiker  0.0000000102328 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0372  arginine/ornithine antiporter  32.37 
 
 
481 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4184  amino acid permease  33.7 
 
 
472 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3333  amino acid permease-associated region  30.63 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2500  amino acid permease-associated region  31.39 
 
 
499 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>