181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0045 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0045  pilin like competence factor  100 
 
 
130 aa  258  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  35.56 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  38.46 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  32.73 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  45.16 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  31.4 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  31.09 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  41.27 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2670  hypothetical protein  35.23 
 
 
319 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.402789  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  43.86 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  32.04 
 
 
353 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.23 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  43.1 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  39.71 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  39.29 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  50.91 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  33.33 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  43.18 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  28.33 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  32.48 
 
 
126 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  36.36 
 
 
176 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  35.63 
 
 
169 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2572  putative type IV pilin  34.15 
 
 
140 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  33.71 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.91 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  45.65 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.3 
 
 
175 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  29.37 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  47.83 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  46.94 
 
 
323 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  38.16 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  30.16 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  34.72 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  30.16 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  31.58 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0303  type IV pilin  30 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  28.05 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  46 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  57.89 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  35.53 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  29.27 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  42.11 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  54.05 
 
 
70 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  52.5 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  38.18 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.73 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  50 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  35.04 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  35.9 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  55.56 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  44.68 
 
 
326 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  52.5 
 
 
124 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  36.11 
 
 
313 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  37.5 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  35.71 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  52.5 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  50 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  35.71 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  34.55 
 
 
338 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  36.51 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  30.33 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  42.86 
 
 
325 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  55.26 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  31.11 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  52.5 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  43.75 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  33.7 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  45.65 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  32.71 
 
 
338 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  35.9 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  32 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  41.3 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  41.67 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  50 
 
 
168 aa  42  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  54.05 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.29 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  54.05 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  43.18 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1551  N-terminal methylation  42.03 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  34.78 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  33.33 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  31.73 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  44.68 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.71 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  44.23 
 
 
176 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  51.52 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  35.8 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  47.37 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  42.22 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  44.44 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  43.64 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>