16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2548 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2548  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00589912  normal  0.471864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01048  hypothetical protein  99.19 
 
 
124 aa  246  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2594  conserved hypothetical protein  99.19 
 
 
124 aa  246  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1173  hypothetical protein  99.19 
 
 
124 aa  246  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.345768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1431  hypothetical protein  99.19 
 
 
124 aa  246  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.304001  normal  0.203415 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01056  hypothetical protein  99.19 
 
 
124 aa  246  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2278  hypothetical protein  98.39 
 
 
124 aa  246  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2078  hypothetical protein  98.39 
 
 
124 aa  245  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.887525  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1174  hypothetical protein  98.39 
 
 
124 aa  243  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.11083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1249  hypothetical protein  91.94 
 
 
124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.311161  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1264  hypothetical protein  91.94 
 
 
124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1220  hypothetical protein  91.94 
 
 
124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504862  normal  0.17472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2036  hypothetical protein  91.94 
 
 
124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2220  hypothetical protein  91.94 
 
 
124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.751941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1567  hypothetical protein  87.1 
 
 
124 aa  222  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40771  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1874  hypothetical protein  68.8 
 
 
125 aa  171  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0609851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>