85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2528 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2528  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 
219 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.728005  normal  0.0178665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1195  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 
219 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2574  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  98.17 
 
 
219 aa  427  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293325  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01068  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein A  98.17 
 
 
219 aa  427  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01076  hypothetical protein  98.17 
 
 
219 aa  427  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  97.72 
 
 
219 aa  407  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2057  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  97.72 
 
 
219 aa  407  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1451  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  97.72 
 
 
219 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1195  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  97.72 
 
 
219 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1285  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  71.69 
 
 
219 aa  329  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115713  normal  0.0340077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2199  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  71.23 
 
 
219 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1241  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  71.23 
 
 
219 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.684745  normal  0.229528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  71.23 
 
 
219 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1270  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  70.78 
 
 
219 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0241853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1586  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  69.86 
 
 
219 aa  310  7.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2971  SAF domain-containing protein  49.25 
 
 
217 aa  211  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272825  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1552  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  45.75 
 
 
222 aa  201  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2599  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  42.08 
 
 
222 aa  188  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1867  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  41.63 
 
 
222 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.563349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1997  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  44.38 
 
 
254 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2426  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  43.82 
 
 
269 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  43.82 
 
 
232 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1524  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  36.28 
 
 
234 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.79 
 
 
320 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2412  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.9 
 
 
310 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3071  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.92 
 
 
315 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3026  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.9 
 
 
310 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.124973  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3045  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.9 
 
 
408 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.279341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3021  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.22 
 
 
388 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2936  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.92 
 
 
418 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2947  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.87 
 
 
424 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1979  flageller protein FlgA  32.55 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3323  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.23 
 
 
254 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2101  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.23 
 
 
254 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2992  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.23 
 
 
254 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0461  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.23 
 
 
254 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3795  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.16 
 
 
504 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0265  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.9 
 
 
509 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0277  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.9 
 
 
507 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  33.16 
 
 
502 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.13 
 
 
295 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.277542  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0239  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.87 
 
 
538 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3733  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.79 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.18 
 
 
249 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1953  flageller protein FlgA  32.26 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.28 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3715  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.53 
 
 
291 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300126 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4792  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.53 
 
 
291 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.245813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.43 
 
 
242 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1318  flageller protein FlgA  32.09 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.72 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594164  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4200  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.62 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23990  Flagellar protein FlgA  27.27 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  33.16 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3099  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.12 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3826  SAF domain-containing protein  28.12 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.294228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4419  SAF domain-containing protein  27.33 
 
 
259 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3713  flageller protein FlgA  30.25 
 
 
246 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0570  SAF domain-containing protein  28.92 
 
 
281 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3074  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  27.06 
 
 
239 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  28.65 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0634  SAF domain-containing protein  27.49 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  25.25 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2735  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.98 
 
 
255 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000036483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  26.78 
 
 
254 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.32 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.32 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.32 
 
 
225 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.32 
 
 
250 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  24.56 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.39 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  24.32 
 
 
248 aa  48.5  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0353  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.56 
 
 
160 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0779084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.53 
 
 
347 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.6 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.56 
 
 
160 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  28.57 
 
 
265 aa  45.4  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3652  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  34.52 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.265024  normal  0.613737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.05 
 
 
314 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  26.85 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  26.4 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0153  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  22.16 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0673541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  20.95 
 
 
245 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0741  flagellar protein FLGA precursor  29.41 
 
 
159 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.56 
 
 
244 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>