19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2003 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2003  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  285  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000101553  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01586  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  285  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00103868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1573  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  285  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256196  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01596  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 146 aa  285  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000718501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1702  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  285  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0601392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1834  hypothetical protein  99.32 
 
 		 146 aa  283  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2338  hypothetical protein  99.32 
 
 		 146 aa  283  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80894  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2015  conserved hypothetical protein  99.32 
 
 		 146 aa  283  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1815  hypothetical protein  99.32 
 
 		 146 aa  283  7e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.137448  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1570  inner membrane protein YdgK  83.56 
 
 		 157 aa  222  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.126281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1630  hypothetical protein  83.56 
 
 		 157 aa  222  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.121402  normal  0.503119 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1558  inner membrane protein YdgK  83.56 
 
 		 157 aa  222  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00206467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1714  inner membrane protein YdgK  83.56 
 
 		 157 aa  222  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1882  inner membrane protein YdgK  83.56 
 
 		 157 aa  222  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1822  putative inner membrane protein  69.18 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060045 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2255  hypothetical protein  53.19 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2005  hypothetical protein  53.19 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1893  hypothetical protein  53.19 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2242  hypothetical protein  51.03 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000470189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>