21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1294 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02285  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.964964  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02246  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.816553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2512  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2663  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1294  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2744  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1282  conserved hypothetical protein  99.53 
 
 		 211 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3607  hypothetical protein  98.58 
 
 		 211 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.558165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2525  hypothetical protein  94.29 
 
 		 207 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3264  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.394493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3249  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.202739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3186  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3365  hypothetical protein  42.79 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3200  hypothetical protein  42.44 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3420  hypothetical protein  30.74 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.672646  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2258  hypothetical protein  32.75 
 
 		 266 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.41821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6380  hypothetical protein  32.16 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1732  hypothetical protein  27.73 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000872806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0028  hypothetical protein  28.97 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.412178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2515  hypothetical protein  34.12 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2572  hypothetical protein  26.44 
 
 		 249 aa  41.6  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.480736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>