11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1054 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0044  putative protein encoded in prophage  100 
 
 		 106 aa  214  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1054  putative protein encoded in prophage  100 
 
 		 106 aa  214  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4010  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  214  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2963  hypothetical protein  89.62 
 
 		 106 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  hitchhiker  0.00000310856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3109  P4 phage protein  87.74 
 
 		 106 aa  192  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.956896  normal  0.201687 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4846  hypothetical protein  71.43 
 
 		 107 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.456397 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0319  hypothetical protein  71.43 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.468761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3270  hypothetical protein  43.16 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0711  hypothetical protein  43.16 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4782  hypothetical protein  42.71 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0380  hypothetical protein  40.62 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.88139  normal  0.374836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>