33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3227 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3227    100 
 
 		 300 bp  595  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  98.25 
 
 		 411 bp  525  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  98.25 
 
 		 366 bp  525  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  98.25 
 
 		 366 bp  525  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  98.25 
 
 		 411 bp  525  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  98.25 
 
 		 411 bp  525  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  98.25 
 
 		 411 bp  525  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  98.25 
 
 		 411 bp  525  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  98.25 
 
 		 411 bp  525  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  97.89 
 
 		 366 bp  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  95.09 
 
 		 366 bp  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0387    95.09 
 
 		 1229 bp  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 366 bp  446  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  94.74 
 
 		 366 bp  446  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  94.74 
 
 		 366 bp  446  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  94.74 
 
 		 366 bp  446  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 366 bp  446  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 366 bp  446  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  94.74 
 
 		 366 bp  446  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 366 bp  446  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  94.74 
 
 		 366 bp  446  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  94.39 
 
 		 366 bp  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1563    94.34 
 
 		 162 bp  244  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398964 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0517    96.19 
 
 		 186 bp  176  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0003    96.19 
 
 		 186 bp  176  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0012    96.19 
 
 		 186 bp  176  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0074    96.19 
 
 		 186 bp  176  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314733  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0238    96.19 
 
 		 186 bp  176  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4787    92.47 
 
 		 480 bp  121  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1562    98.25 
 
 		 138 bp  105  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  86.52 
 
 		 369 bp  81.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0075  hypothetical protein  88.14 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.16064e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  86.27 
 
 		 258 bp  46.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>