16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2880 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2880  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  205  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02621  conserved hypothetical protein  55.68 
 
 		 282 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3082  hypothetical protein  54.65 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000103876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2916  hypothetical protein  53.62 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0854  hypothetical protein  46.34 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2893  hypothetical protein  58.82 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3247  hypothetical protein  55.1 
 
 		 51 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.235379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00874  hypothetical protein  48.08 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1366  hypothetical protein  32.32 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0265847  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0166  hypothetical protein  38.1 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1342  hypothetical protein  41.67 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1373  hypothetical protein  37.84 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00827993  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2917  hypothetical protein  50.98 
 
 		 56 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137281  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3146  hypothetical protein  66.67 
 
 		 40 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.644907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3165  hypothetical protein  66.67 
 
 		 39 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00145067  normal  0.652343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3164  hypothetical protein  58.62 
 
 		 38 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00462673  normal  0.663179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>