45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2172 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1062  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  376  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000404596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2370  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  376  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000438094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1055  hypothetical protein  99.44 
 
 		 192 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000152866  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00950  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000481867  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2650  hypothetical protein  99.44 
 
 		 180 aa  374  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000222204  hitchhiker  0.00136169 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000720846  normal  0.548871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1111  hypothetical protein  99.44 
 
 		 180 aa  373  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000798367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00957  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000043428  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2697  protein of unknown function DUF1379  100 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1121  hypothetical protein  90 
 
 		 180 aa  338  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000020025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1168  hypothetical protein  90 
 
 		 180 aa  338  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1017  hypothetical protein  90 
 
 		 180 aa  338  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1134  hypothetical protein  89.44 
 
 		 180 aa  337  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000982581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1100  hypothetical protein  89.44 
 
 		 180 aa  337  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000278688  normal  0.979785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1458  hypothetical protein  84.44 
 
 		 180 aa  325  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00224961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2643  hypothetical protein  67.07 
 
 		 183 aa  237  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.284098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2554  hypothetical protein  67.07 
 
 		 183 aa  237  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1985  hypothetical protein  66.47 
 
 		 183 aa  235  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1741  hypothetical protein  65.27 
 
 		 182 aa  229  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0888818  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2062  protein of unknown function DUF1379  60.23 
 
 		 195 aa  221  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1789  hypothetical protein  60.48 
 
 		 195 aa  218  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1678  protein of unknown function DUF1379  58.33 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.439377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1647  protein of unknown function DUF1379  57.4 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003437  hypothetical protein  38.79 
 
 		 180 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02338  hypothetical protein  36.36 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1550  hypothetical protein  35.84 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1097  hypothetical protein  33.73 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1811  hypothetical protein  34.46 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000237995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1731  hypothetical protein  32.77 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2431  hypothetical protein  31.76 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2438  hypothetical protein  31.76 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1913  protein of unknown function DUF1379  31.76 
 
 		 177 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0618258  normal  0.219466 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2551  hypothetical protein  31.76 
 
 		 177 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0408424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1944  hypothetical protein  31.18 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1594  hypothetical protein  31.61 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000237237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2591  hypothetical protein  31.18 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2474  hypothetical protein  31.95 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.411375  hitchhiker  0.00395627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1757  hypothetical protein  31.18 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0511465  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1682  hypothetical protein  31.18 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0455206  normal  0.0971581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1787  hypothetical protein  31.18 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0844368  normal  0.271795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2142  hypothetical protein  31.95 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.883221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2193  hypothetical protein  30.59 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2219  hypothetical protein  30.18 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2004  hypothetical protein  28.49 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0401483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2298  hypothetical protein  30.5 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>