More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2017 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01105  respiratory NADH dehydrogenase 2/cupric reductase  99.08 
 
 
434 aa  889    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2538  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  99.31 
 
 
434 aa  890    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0764017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2214  NADH dehydrogenase  99.08 
 
 
434 aa  887    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2017  NADH dehydrogenase  100 
 
 
434 aa  897    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000943189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2820  NADH dehydrogenase  82.03 
 
 
434 aa  717    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667715  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2486  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  80.41 
 
 
434 aa  712    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1702  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  82.03 
 
 
434 aa  717    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1310  NADH dehydrogenase  97.24 
 
 
434 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000027785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2158  NADH dehydrogenase  97 
 
 
443 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000756944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1974  NADH dehydrogenase  97.24 
 
 
434 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1325  NADH dehydrogenase  97 
 
 
443 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  hitchhiker  0.00000413212 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1594  NADH dehydrogenase  82.03 
 
 
434 aa  717    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2492  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  99.31 
 
 
434 aa  890    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000379984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1926  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  81.8 
 
 
434 aa  721    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.886684  hitchhiker  0.0000426907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1624  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  91.47 
 
 
434 aa  813    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.544426  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1639  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  81.76 
 
 
435 aa  723    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1608  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  79.68 
 
 
435 aa  701    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381019  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2792  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  80.65 
 
 
434 aa  715    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1287  NADH dehydrogenase  97 
 
 
443 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.174248  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1480  NADH dehydrogenase  74.34 
 
 
434 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.538413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1489  NADH dehydrogenase  98.62 
 
 
434 aa  882    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1232  NADH dehydrogenase  99.31 
 
 
434 aa  890    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01525  NADH dehydrogenase  74.33 
 
 
429 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1231  NADH dehydrogenase  99.31 
 
 
434 aa  890    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378074  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1311  NADH dehydrogenase  72.33 
 
 
429 aa  629  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003997  NADH dehydrogenase  74.09 
 
 
429 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1985  fused respiratory FAD-dependent NADH dehydrogenase and cupric reductase  66.74 
 
 
428 aa  589  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.13803  normal  0.853629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3414  NADH dehydrogenase  58.53 
 
 
433 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2098  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.99 
 
 
433 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000978799  normal  0.232961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2257  NADH dehydrogenase  56.98 
 
 
429 aa  498  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.696772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2195  NADH dehydrogenase  57.38 
 
 
433 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0626  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.04 
 
 
431 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0672  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.04 
 
 
431 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.04 
 
 
431 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0402437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.54 
 
 
433 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58870  NADH dehydrogenase  57.14 
 
 
435 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0525175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4544  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.58 
 
 
431 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.939793  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1161  NADH dehydrogenase  55.71 
 
 
433 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00528742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5174  NADH dehydrogenase  56.45 
 
 
435 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1148  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.94 
 
 
433 aa  478  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1242  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.63 
 
 
432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1253  NADH dehydrogenase  54.08 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.674072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4831  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.05 
 
 
432 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.231283  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2220  NADH dehydrogenase  56.25 
 
 
437 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2325  NADH dehydrogenase  53.33 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03829  Respiratory NADH dehydrogenase II  52.09 
 
 
430 aa  455  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0790  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.12 
 
 
432 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0917  NADH dehydrogenase  54.88 
 
 
432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0140  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.57 
 
 
436 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12000  uncoupled NADH:quinone oxidoreductase  53.83 
 
 
432 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3680  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.25 
 
 
443 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4267  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.05 
 
 
452 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0991  NADH dehydrogenase  51.8 
 
 
445 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.77 
 
 
465 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.71 
 
 
437 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.618936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4539  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.71 
 
 
440 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859142  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2640  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.96 
 
 
443 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2763  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.73 
 
 
443 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3718  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.69 
 
 
444 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4266  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.25 
 
 
401 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2866  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.96 
 
 
443 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4164  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.48 
 
 
437 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5340  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.65 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2168  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.41 
 
 
456 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  0.677345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.05 
 
 
444 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.364819  hitchhiker  0.000890266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1918  NADH dehydrogenase  49.76 
 
 
440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.272747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1294  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.2 
 
 
436 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.746503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5532  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.93 
 
 
430 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2217  NADH dehydrogenase  47.56 
 
 
463 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540437  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3616  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.16 
 
 
430 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4134  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.75 
 
 
433 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  normal  0.133258 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4751  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.16 
 
 
430 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0874  NADH dehydrogenase  49.66 
 
 
444 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.357726  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0999  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.93 
 
 
430 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2623  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.2 
 
 
467 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154931  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2434  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.81 
 
 
444 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4598  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.06 
 
 
433 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574175  normal  0.0132021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4826  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.1 
 
 
444 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0239032  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2833  putative NADH dehydrogenase  46.99 
 
 
449 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2041  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.57 
 
 
444 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0563919  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2229  NADH dehydrogenase, membrane flavoprotein FAD NAD ubiquinone electron transport oxidoreductase  48.33 
 
 
441 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3654  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.1 
 
 
444 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.141344  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6787  NADH dehydrogenase  46.77 
 
 
449 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000879358  hitchhiker  0.00000494045 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4420  NADH dehydrogenase  46.9 
 
 
448 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0675814  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4492  NADH dehydrogenase  47.1 
 
 
444 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3873  NADH dehydrogenase  47.1 
 
 
444 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0320  NADH dehydrogenase  45.43 
 
 
460 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1697  NADH dehydrogenase  45.43 
 
 
460 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1501  NADH dehydrogenase  45.43 
 
 
460 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743235  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0850  NADH dehydrogenase  45.43 
 
 
460 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560446  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3770  NADH dehydrogenase  47.1 
 
 
444 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563923  normal  0.0226708 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0354  NADH dehydrogenase  45.43 
 
 
460 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2545  NADH dehydrogenase  45.43 
 
 
460 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2402  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.43 
 
 
460 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3244  NADH dehydrogenase  47.1 
 
 
444 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  0.0259001 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0606  NADH dehydrogenase  45 
 
 
460 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.436779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3455  NADH dehydrogenase  47.73 
 
 
440 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0936  NADH dehydrogenase  45.92 
 
 
429 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.151731  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3925  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.78 
 
 
430 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3431  NADH dehydrogenase  44.44 
 
 
429 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>