8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1364 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01794  hypothetical protein  100 
 
 		 47 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000557721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1914  hypothetical protein  100 
 
 		 47 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2052  hypothetical protein  100 
 
 		 47 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000372746  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1364  hypothetical protein  100 
 
 		 47 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000588654  normal  0.0142087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2555  hypothetical protein  100 
 
 		 47 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01782  hypothetical protein  100 
 
 		 47 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000969723  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1662  hypothetical protein  84.62 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000154288  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2475  hypothetical protein  84.62 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>