More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0325 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0325  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  100 
 
 
380 aa  782    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0345  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  97.89 
 
 
380 aa  768    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0352016  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2284  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.53 
 
 
384 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7286  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.52 
 
 
384 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.423648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0837  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.68 
 
 
377 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1532  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.33 
 
 
374 aa  332  6e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0542  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  39.05 
 
 
375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0956  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.79 
 
 
375 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0975  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.79 
 
 
375 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0516  NADH:flavin oxidoreductase  38.08 
 
 
372 aa  258  9e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2008  NADH:flavin oxidoreductase  38.53 
 
 
396 aa  247  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  35.83 
 
 
926 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  35.68 
 
 
957 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1866  NADH:flavin oxidoreductase  38.71 
 
 
389 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151913  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  38.02 
 
 
1004 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  35.92 
 
 
925 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf867  NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.57 
 
 
367 aa  229  6e-59  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0493  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.93 
 
 
368 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00242088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  36.71 
 
 
1005 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  35.14 
 
 
925 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1933  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.21 
 
 
375 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.15 
 
 
654 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1061  oxidoreductase, FMN-binding  31.56 
 
 
399 aa  176  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.777824  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0450  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  32.01 
 
 
392 aa  175  9e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0166018  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.58 
 
 
662 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.550194 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0381  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.91 
 
 
399 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0370  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.91 
 
 
399 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2693  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.83 
 
 
363 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.71 
 
 
330 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  31.83 
 
 
685 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0007  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.69 
 
 
368 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.25 
 
 
652 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.37 
 
 
329 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2193  NADH oxidase  30.77 
 
 
637 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.78 
 
 
331 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0870  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.24 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0233  NADH:flavin oxidoreductase  31.01 
 
 
394 aa  156  7e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2028  NADPH dehydrogenase NamA  33.8 
 
 
345 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1893  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.61 
 
 
341 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  31.87 
 
 
650 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1843  NADPH dehydrogenase NamA  32.4 
 
 
345 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1888  NADPH dehydrogenase NamA  32.96 
 
 
345 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0520303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2070  NADPH dehydrogenase NamA  32.39 
 
 
345 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2139  NADPH dehydrogenase NamA  32.11 
 
 
345 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2106  NADPH dehydrogenase NamA  31.83 
 
 
345 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3281  NADPH dehydrogenase NamA  33.24 
 
 
345 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1853  NADPH dehydrogenase NamA  32.4 
 
 
345 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2779  hypothetical protein  30.65 
 
 
351 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.48 
 
 
646 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1891  NADPH dehydrogenase NamA  32.68 
 
 
345 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2038  NADPH dehydrogenase NamA  32.68 
 
 
345 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  29.46 
 
 
335 aa  149  7e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.22 
 
 
644 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3603  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.4 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0201942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1344  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.99 
 
 
676 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.31 
 
 
937 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0011  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.34 
 
 
337 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0271468  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0415  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.97 
 
 
556 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.291611  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2275  NADPH dehydrogenase NamA  32.43 
 
 
340 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000882972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2818  NADH peroxidase  30.42 
 
 
365 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.609535  normal  0.162723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2193  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.46 
 
 
645 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000298441  normal  0.0270911 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1034  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.92 
 
 
373 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.03 
 
 
370 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271539  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2864  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.81 
 
 
364 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1521  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  28.84 
 
 
363 aa  144  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0991622 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1709  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.52 
 
 
369 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.069385  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.06 
 
 
387 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0239278  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3142  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.14 
 
 
645 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.1 
 
 
364 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2699  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.88 
 
 
418 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0350  NADPH dehydrogenase NamA  32.94 
 
 
340 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2716  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.82 
 
 
362 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.94 
 
 
364 aa  142  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.06 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3010  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.23 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1392  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.66 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.32 
 
 
612 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1529  NADPH dehydrogenase NamA  31.65 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1551  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2994  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.88 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135247  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4518  FMN oxidoreductase  28.03 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  31.21 
 
 
370 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3367  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.53 
 
 
369 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.45 
 
 
387 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.84 
 
 
364 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.438588  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1046  NADH:flavin oxidoreductase  40.57 
 
 
265 aa  140  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.140197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.05 
 
 
667 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1496  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.27 
 
 
399 aa  139  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.18 
 
 
355 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63640  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  30.7 
 
 
681 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.771531  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5533  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  30.99 
 
 
681 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4544  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.25 
 
 
355 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.55 
 
 
355 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1515  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.86 
 
 
686 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556111  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.67 
 
 
368 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01808  oxidoreductase, FMN-binding protein  29.14 
 
 
389 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  29.94 
 
 
363 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.16 
 
 
370 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.708176  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.16 
 
 
370 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.559957  normal  0.67017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.16 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>