100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0106 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3499  protein of unknown function DUF1342  99.6 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00102  hypothetical protein  99.6 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0107  hypothetical protein  99.6 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.5196600000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3556  hypothetical protein  99.6 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0592324  hitchhiker  0.00149643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0106  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000133684  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0095  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000780213  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00101  hypothetical protein  99.6 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0109  hypothetical protein  99.19 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000114544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0104  hypothetical protein  99.19 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0150  hypothetical protein  89.88 
 
 		 247 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0156  hypothetical protein  89.88 
 
 		 247 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0152  hypothetical protein  89.88 
 
 		 247 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.100113  normal  0.0179013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0152  hypothetical protein  90.28 
 
 		 247 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0088141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0158  hypothetical protein  89.88 
 
 		 247 aa  440  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000114197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0647  hypothetical protein  77.73 
 
 		 247 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.357477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0773  hypothetical protein  70.78 
 
 		 250 aa  350  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178717  normal  0.389358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3768  hypothetical protein  67.76 
 
 		 250 aa  344  6e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172849  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3580  hypothetical protein  67.35 
 
 		 250 aa  340  9e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000469577  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1046  hypothetical protein  68.02 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.032297  normal  0.0298064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3504  hypothetical protein  68.02 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000650274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3375  hypothetical protein  68.02 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.364357  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0661  hypothetical protein  62.96 
 
 		 250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0622  hypothetical protein  60.32 
 
 		 249 aa  308  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.023756  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03473  hypothetical protein  41.74 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002541  hypothetical protein  41.74 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2005  hypothetical protein  40.91 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000011223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03235  hypothetical protein  37.25 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000018108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2634  hypothetical protein  39 
 
 		 248 aa  178  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0365  hypothetical protein  37.8 
 
 		 244 aa  174  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000820765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0409  hypothetical protein  35.37 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0301  hypothetical protein  36.59 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0415  hypothetical protein  36.99 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000349234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3427  hypothetical protein  37.4 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0421  hypothetical protein  36.18 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3442  hypothetical protein  34.55 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3393  hypothetical protein  36.89 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0412  hypothetical protein  36.59 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4451  hypothetical protein  37.7 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1160  hypothetical protein  34.16 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3609  hypothetical protein  37.4 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0416  hypothetical protein  37.4 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3946  hypothetical protein  36.99 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3871  hypothetical protein  36.99 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3340  hypothetical protein  37.1 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4064  hypothetical protein  36.99 
 
 		 244 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3923  hypothetical protein  36.99 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2227  hypothetical protein  33.2 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000469933  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0505  hypothetical protein  34.39 
 
 		 250 aa  148  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0783  hypothetical protein  33.98 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0927692  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2091  hypothetical protein  33.07 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2129  hypothetical protein  33.73 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2366  hypothetical protein  32.66 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613866  normal  0.127948 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0656  protein of unknown function DUF1342  38.25 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.514378  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3708  hypothetical protein  31.89 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.734931  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4226  hypothetical protein  30.12 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3787  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0845  hypothetical protein  32.14 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.395907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2906  hypothetical protein  32.14 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0764  hypothetical protein  32.02 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0801  hypothetical protein  32.02 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.64253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3923  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0117582  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3684  hypothetical protein  32.14 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0546  hypothetical protein  33.47 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2024  hypothetical protein  34.1 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.220235  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0770  hypothetical protein  32.63 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2822  hypothetical protein  31.47 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.523565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2709  hypothetical protein  32.81 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3074  hypothetical protein  32.81 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3659  hypothetical protein  31.08 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180872  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2829  hypothetical protein  32.81 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0324685  normal  0.149552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0477  hypothetical protein  31.08 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0502  hypothetical protein  31.08 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187312  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3456  hypothetical protein  31.87 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  hitchhiker  0.00159769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2535  hypothetical protein  31.89 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3531  hypothetical protein  31.89 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3535  hypothetical protein  31.89 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3510  hypothetical protein  31.89 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3247  hypothetical protein  31.89 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1315  hypothetical protein  31.89 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0457  hypothetical protein  31.89 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3657  hypothetical protein  33.47 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1132  hypothetical protein  31.89 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0544  hypothetical protein  30.68 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131406  normal  0.135825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2659  hypothetical protein  31.17 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0092  hypothetical protein  30.28 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0574  hypothetical protein  30.28 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.251694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2083  hypothetical protein  32.49 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5492  hypothetical protein  31.76 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340017  normal  0.223595 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1956  hypothetical protein  30.83 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2964  hypothetical protein  32.07 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218818  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0242  hypothetical protein  30.83 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.694763  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3112  hypothetical protein  30.51 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0198  protein of unknown function DUF1342  30.08 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.229656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0182  hypothetical protein  30.2 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.741291  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2188  protein of unknown function DUF1342  29.81 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0188  hypothetical protein  32.03 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.477453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0367  protein of unknown function DUF1342  32.03 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.320961 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1422  hypothetical protein  25.52 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1562  hypothetical protein  25.52 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>