20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3178 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0698  conserved hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  199  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3178  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  199  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3468  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  199  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0695  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  199  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3425  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  199  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4311  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  199  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02823  hypothetical protein  98.95 
 
 
95 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3285  hypothetical protein  98.95 
 
 
95 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02874  hypothetical protein  98.95 
 
 
95 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3406  hypothetical protein  77.66 
 
 
95 aa  163  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3399  hypothetical protein  78.72 
 
 
95 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.951858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3325  hypothetical protein  78.72 
 
 
95 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3334  hypothetical protein  78.72 
 
 
95 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3405  hypothetical protein  78.72 
 
 
95 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3500  hypothetical protein  77.66 
 
 
95 aa  156  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.945928  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4476  hypothetical protein  47.25 
 
 
97 aa  103  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4191  hypothetical protein  46.15 
 
 
97 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3145  hypothetical protein  51.06 
 
 
95 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0008  hypothetical protein  45.05 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0011  hypothetical protein  40.66 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>