69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3090 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02763  predicted fused mannitol-specific PTS enzymes: IIB component/IIC component  100 
 
 		 462 aa  813    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0778  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  100 
 
 		 462 aa  813    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0229075 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3365  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  100 
 
 		 462 aa  813    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3320  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  88.61 
 
 		 459 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3267  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  100 
 
 		 462 aa  813    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3253  pts system mannitol-specific eiicba component  88.61 
 
 		 459 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3090  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component, truncation  100 
 
 		 407 aa  815    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4234  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  100 
 
 		 462 aa  813    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02726  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  813    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0761  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  100 
 
 		 462 aa  813    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001413  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIBC subunit  64.73 
 
 		 420 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.259327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3834  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  59.86 
 
 		 478 aa  497  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.826504  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1252  mannitol-specific IIABC component, PTS system  50.48 
 
 		 625 aa  398  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000146575  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0088  PTS system, mannitol-specific IIABC protein  49.03 
 
 		 628 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0985  PTS system, mannitol-specific IIABC protein  49.03 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.150194 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001632  phosphotransferase system mannitol-specific  46.79 
 
 		 650 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0196  PTS system, mannitol-specific IIABC component  46.08 
 
 		 649 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00834  PTS system, mannitol-specific II ABC component  46.79 
 
 		 650 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2813  PTS system, mannitol-specific EIICBA component  47.26 
 
 		 650 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4128  PTS system, mannitol-specific EIICBA component  51.57 
 
 		 643 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4165  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  50.78 
 
 		 635 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4447  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  51.3 
 
 		 635 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0026  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  51.57 
 
 		 643 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0268  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  49.4 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3780  PTS system mannitol-specific transporter subunit IIABC  51.57 
 
 		 643 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03405  hypothetical protein  49.76 
 
 		 637 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4969  PTS system, mannitol-specific IIABC component  49.76 
 
 		 637 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.873696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4016  PTS system, mannitol-specific IIABC component  49.76 
 
 		 637 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.659103  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0052  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  50.6 
 
 		 635 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3932  PTS system, mannitol-specific IIABC component  49.76 
 
 		 637 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.754882 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03454  fused mannitol-specific PTS enzymes: IIA components/IIB components/IIC components  49.76 
 
 		 637 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0113  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  49.76 
 
 		 637 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0107  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  49.76 
 
 		 637 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3806  PTS system, mannitol-specific IIABC component  49.76 
 
 		 637 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4098  PTS system, mannitol-specific IIABC component  49.76 
 
 		 637 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0220  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  46.89 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0136  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  48.93 
 
 		 636 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0072  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  48.67 
 
 		 639 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3963  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  49.52 
 
 		 638 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303673  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4008  PTS system mannitol-specific eiicba component  49.52 
 
 		 638 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.32191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3885  pts system mannitol-specific eiicba component  49.52 
 
 		 638 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.816196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3901  pts system mannitol-specific eiicba component  49.52 
 
 		 638 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4070  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  49.52 
 
 		 638 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.293886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1219  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  46.51 
 
 		 660 aa  362  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1845  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  45.57 
 
 		 467 aa  352  5e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5589  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  46.72 
 
 		 658 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3789  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  47.58 
 
 		 676 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4004  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  44.37 
 
 		 657 aa  334  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.852778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2188  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  40.27 
 
 		 512 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2226  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  40.27 
 
 		 512 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3164  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2  43.86 
 
 		 668 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0027  phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component  42.23 
 
 		 607 aa  316  5e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.03795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0054  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  42.25 
 
 		 512 aa  312  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4768  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  42.25 
 
 		 508 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1525  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  51.63 
 
 		 356 aa  305  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.003101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7073  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.75 
 
 		 391 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2143  PTS systemmannitol-specific transporter subunit IIC  43.91 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07060  phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component  39.56 
 
 		 687 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4224  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  50.49 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5271  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.81 
 
 		 397 aa  285  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0659  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  37.07 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4849  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  48.78 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0028  PTS system, mannitol-specific IIBC component, putative  32.5 
 
 		 517 aa  209  1e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0458  PTS system, mannitol-specific IIBC component  28.67 
 
 		 525 aa  196  7e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.646775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7072  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  43.21 
 
 		 102 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5270  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  34.78 
 
 		 102 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4848  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  40.96 
 
 		 102 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1526  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  32.98 
 
 		 106 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.022737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4223  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  33.72 
 
 		 102 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>