More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3083 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02756  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
359 aa  747    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0768  fructose-bisphosphate aldolase, class II  100 
 
 
359 aa  747    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.366427  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3817  fructose-bisphosphate aldolase  91.36 
 
 
359 aa  697    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3230  fructose-bisphosphate aldolase  98.33 
 
 
359 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3083  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
359 aa  747    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0850  fructose-bisphosphate aldolase  91.36 
 
 
359 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.961226  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3308  fructose-bisphosphate aldolase  98.33 
 
 
359 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3944  fructose-bisphosphate aldolase  89.42 
 
 
359 aa  684    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.910898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0853  fructose-bisphosphate aldolase  91.36 
 
 
359 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000607059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3350  fructose-bisphosphate aldolase  99.72 
 
 
359 aa  745    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3700  fructose-bisphosphate aldolase  91.09 
 
 
358 aa  687    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.239509  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3897  fructose-bisphosphate aldolase  90.25 
 
 
358 aa  684    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3241  fructose-bisphosphate aldolase  98.61 
 
 
359 aa  737    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4222  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
359 aa  747    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3062  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
359 aa  747    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.150625  normal  0.294869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0555  fructose-bisphosphate aldolase  86.63 
 
 
358 aa  660    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0514  fructose-bisphosphate aldolase  86.63 
 
 
358 aa  660    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3410  fructose-bisphosphate aldolase  98.33 
 
 
359 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.118089 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0785  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
359 aa  747    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3338  fructose-bisphosphate aldolase  94.71 
 
 
359 aa  720    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3305  fructose-bisphosphate aldolase  98.33 
 
 
359 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0651227  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3253  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
359 aa  747    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.878891  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0031  fructose-bisphosphate aldolase  80.5 
 
 
358 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.218683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03564  fructose-bisphosphate aldolase  79.39 
 
 
358 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002473  fructose-bisphosphate aldolase class II  79.94 
 
 
358 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0372  fructose-bisphosphate aldolase  77.22 
 
 
358 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0662896  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0206  fructose-bisphosphate aldolase  74.37 
 
 
359 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0557  fructose-bisphosphate aldolase  76.6 
 
 
358 aa  561  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0509  fructose-bisphosphate aldolase  70.62 
 
 
357 aa  531  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0110  fructose-bisphosphate aldolase  69.32 
 
 
355 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2688  fructose-bisphosphate aldolase  70.47 
 
 
359 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.209388 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1339  fructose-bisphosphate aldolase, class II  68.82 
 
 
358 aa  520  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0646  fructose-bisphosphate aldolase  67.41 
 
 
358 aa  519  1e-146  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.598975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1415  fructose-bisphosphate aldolase  67.24 
 
 
359 aa  504  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0793639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0254  fructose-bisphosphate aldolase, class II  69.08 
 
 
359 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0117371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1277  fructose-bisphosphate aldolase  66.39 
 
 
359 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000957639  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0913  fructose-bisphosphate aldolase  65.63 
 
 
354 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.906475  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12268  fructose-bisphosphate aldolase  64.77 
 
 
355 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0700  fructose-bisphosphate aldolase  64.51 
 
 
354 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2070  fructose-bisphosphate aldolase  63.66 
 
 
354 aa  479  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.556466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3279  fructose-bisphosphate aldolase  63.27 
 
 
365 aa  478  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.032086  normal  0.0544122 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3060  fructose-bisphosphate aldolase  67.53 
 
 
365 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1072  fructose-bisphosphate aldolase  64.51 
 
 
354 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.132066  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0625  fructose-bisphosphate aldolase  64.79 
 
 
354 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.718371  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1220  fructose-bisphosphate aldolase  64.23 
 
 
354 aa  476  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.781529  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1463  fructose-bisphosphate aldolase  68.18 
 
 
355 aa  475  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0451  fructose-bisphosphate aldolase  61.69 
 
 
359 aa  476  1e-133  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0515  fructose-bisphosphate aldolase  62.64 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3665  fructose-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0396851 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0113  fructose-bisphosphate aldolase  63.66 
 
 
354 aa  457  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22993  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.02 
 
 
439 aa  402  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29014  cytosolic class II aldolase  53.78 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00300  fructose-bisphosphate aldolase, putative  53.95 
 
 
359 aa  389  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000000441241  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94831  predicted protein  56.6 
 
 
339 aa  382  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.179075  normal  0.245403 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02875  hypothetical protein similar to fructose 1,6-biphosphate aldolase (Eurofung)  54.18 
 
 
360 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85951  fructose-bisphosphate aldolase  53.69 
 
 
359 aa  372  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0670  fructose-bisphosphate aldolase  42.6 
 
 
345 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0305767  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0511  fructose-bisphosphate aldolase, class II  41.43 
 
 
342 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0234  fructose-bisphosphate aldolase  42.9 
 
 
345 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.644584  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6917  fructose-bisphosphate aldolase  42.57 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.593833  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0721  fructose-bisphosphate aldolase  41.25 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1853  fructose-bisphosphate aldolase  40.34 
 
 
356 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1469  fructose-bisphosphate aldolase  42.65 
 
 
344 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0227656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0492  fructose-bisphosphate aldolase  39.89 
 
 
345 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523521  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0503  fructose-bisphosphate aldolase  39.89 
 
 
345 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4782  fructose-bisphosphate aldolase, class II  41.67 
 
 
344 aa  239  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0514  fructose-bisphosphate aldolase  39.89 
 
 
345 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641702  normal  0.845407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4124  fructose-bisphosphate aldolase  41.26 
 
 
340 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.493234  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0518  fructose-bisphosphate aldolase  42.26 
 
 
339 aa  236  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4064  fructose-bisphosphate aldolase, class II  41.19 
 
 
344 aa  235  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05650  fructose-bisphosphate aldolase  40.45 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.456555  normal  0.714487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8387  fructose-bisphosphate aldolase  40.06 
 
 
341 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4364  fructose-bisphosphate aldolase  40.74 
 
 
345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00568724  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2125  fructose-bisphosphate aldolase  41.07 
 
 
342 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0658  fructose-bisphosphate aldolase  41.37 
 
 
339 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4350  fructose-bisphosphate aldolase  40.46 
 
 
343 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38240  fructose-bisphosphate aldolase  39.88 
 
 
342 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0391  fructose-bisphosphate aldolase, class II  41.54 
 
 
340 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0217  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 
344 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.113705 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2153  fructose-bisphosphate aldolase, class II  40.59 
 
 
341 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0130  fructose-bisphosphate aldolase  40.06 
 
 
340 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0207  fructose-bisphosphate aldolase, class II  39.7 
 
 
340 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02060  fructose-bisphosphate aldolase  40.64 
 
 
340 aa  223  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5147  fructose-bisphosphate aldolase  40.53 
 
 
344 aa  222  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10368  fructose-bisphosphate aldolase  40.95 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3010  fructose-bisphosphate aldolase  39.88 
 
 
340 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.406027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25740  fructose-bisphosphate aldolase  38.9 
 
 
341 aa  219  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4633  fructose-bisphosphate aldolase, class II  38.87 
 
 
340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.406507  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0178  fructose-bisphosphate aldolase  38.28 
 
 
340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.758493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0135  fructose-bisphosphate aldolase  39.47 
 
 
340 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2420  fructose-bisphosphate aldolase  40.77 
 
 
340 aa  215  9e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.968558  normal  0.228515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0244  fructose-bisphosphate aldolase class II  39.47 
 
 
341 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1348  fructose-bisphosphate aldolase  36.36 
 
 
355 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3142  fructose-bisphosphate aldolase, class II  39.35 
 
 
340 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0879085  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35240  fructose-bisphosphate aldolase  39.58 
 
 
340 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2968  fructose-bisphosphate aldolase, class II  39.29 
 
 
340 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.108432  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0114  fructose-bisphosphate aldolase, class II  36.29 
 
 
351 aa  204  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3640  fructose-bisphosphate aldolase  38.1 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.679322 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  27.05 
 
 
286 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0935  fructose-bisphosphate aldolase, class II  26.89 
 
 
370 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>