19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2916 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2916  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  244  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144529  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02621  conserved hypothetical protein  51.82 
 
 		 282 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3082  hypothetical protein  48.21 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000103876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2880  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1342  hypothetical protein  42.73 
 
 		 238 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2893  hypothetical protein  50.65 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0854  hypothetical protein  40.91 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1370  hypothetical protein  36.04 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103597  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2917  hypothetical protein  60.78 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1373  hypothetical protein  33.91 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00827993  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0166  hypothetical protein  40.5 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1367  hypothetical protein  38.78 
 
 		 181 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1366  hypothetical protein  38.04 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0265847  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1369  hypothetical protein  37.36 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0323881  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00875  hypothetical protein  34.74 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3247  hypothetical protein  51.02 
 
 		 51 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.235379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1372  hypothetical protein  36.25 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00893716  normal  0.846814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1368  hypothetical protein  36 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0277289  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1371  hypothetical protein  39.44 
 
 		 78 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794296  normal  0.849954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>