26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0043 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0043    100 
 
 		 946 bp  1875    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.545705  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0064    99.58 
 
 		 946 bp  1844    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4852  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  98.2 
 
 		 945 bp  1733    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0263  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  97.67 
 
 		 945 bp  1693    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0114  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  87.62 
 
 		 1032 bp  97.6  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1331  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  83.33 
 
 		 972 bp  71.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0569564  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1785  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  82.88 
 
 		 972 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000932441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01826  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  82.88 
 
 		 972 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000488329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01814  hypothetical protein  82.88 
 
 		 972 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000463941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1948  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  82.88 
 
 		 972 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.301276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2085  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  82.88 
 
 		 972 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000393849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2591  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  82.88 
 
 		 972 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00419583  normal  0.625718 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1777  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  82.88 
 
 		 972 bp  61.9  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00204072  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2113  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  85.37 
 
 		 972 bp  60  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.098937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1829  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  87.72 
 
 		 972 bp  58  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0951  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  81.98 
 
 		 972 bp  54  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00400893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2043  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  84.51 
 
 		 972 bp  54  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2424  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  88 
 
 		 972 bp  52  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0728697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2138  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  81.9 
 
 		 963 bp  50.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.265497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2415  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  81.9 
 
 		 963 bp  50.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000861118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2025  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  81.9 
 
 		 963 bp  50.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000149839  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2048  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  83.82 
 
 		 972 bp  48.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.327548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2103  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  83.82 
 
 		 972 bp  48.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447054  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1235  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  83.82 
 
 		 972 bp  48.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0136133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1359  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  83.82 
 
 		 972 bp  48.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2249  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  83.33 
 
 		 987 bp  48.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>