9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0037 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0037  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0043  lytic transglycosylase  58.75 
 
 		 215 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  47.92 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5072  transglycosylase SLT domain protein  57.14 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.110513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  51.43 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  51.43 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0042  pilT protein  41.82 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4280  lytic transglycosylase, catalytic  58.06 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>