47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4853 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4853  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0063  hypothetical protein  99.37 
 
 
316 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0262  hypothetical protein  98.42 
 
 
316 aa  653    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0044  hypothetical protein  99.05 
 
 
316 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793542  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2956  virulence protein  50.88 
 
 
309 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  hitchhiker  0.00000541429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2922  hypothetical protein  50.88 
 
 
309 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0345216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2975  virulence protein  50.53 
 
 
309 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.188395 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2892  virulence protein  50.88 
 
 
309 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3078  hypothetical protein  50.53 
 
 
309 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1208  protein of unknown function DUF535  38.3 
 
 
331 aa  205  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2837  protein of unknown function DUF535  36.91 
 
 
316 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2719  hypothetical protein  37.86 
 
 
330 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.805745  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2613  hypothetical protein  33.56 
 
 
315 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2697  hypothetical protein  33.56 
 
 
315 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0981  hypothetical protein  37.86 
 
 
330 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.47492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1595  hypothetical protein  33.56 
 
 
315 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2284  hypothetical protein  37.86 
 
 
330 aa  175  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00241499  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2453  hypothetical protein  37.86 
 
 
330 aa  175  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0233718  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00888  hypothetical protein  37.86 
 
 
330 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2765  protein of unknown function DUF535  37.86 
 
 
330 aa  176  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0819238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0949  hypothetical protein  37.86 
 
 
330 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.422443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00882  hypothetical protein  37.86 
 
 
330 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1037  hypothetical protein  37.86 
 
 
330 aa  175  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1394  hypothetical protein  34.15 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2409  hypothetical protein  37.01 
 
 
313 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0941  hypothetical protein  35.48 
 
 
316 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.374104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1058  hypothetical protein  35.13 
 
 
316 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1007  hypothetical protein  35.13 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.690632  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1038  hypothetical protein  35.13 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.687101  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0975  VirK-like protein  35.13 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.587318  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4270  hypothetical protein  32.85 
 
 
345 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1669  hypothetical protein  32 
 
 
322 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0935  hypothetical protein  28.03 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0127626  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2907  hypothetical protein  27.51 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1515  hypothetical protein  30.04 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1902  hypothetical protein  31.6 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.956039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2717  hypothetical protein  30.54 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3138  VirK domain-containing protein  30.54 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2576  hypothetical protein  30.54 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3894  hypothetical protein  24.33 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831211  normal  0.569871 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000760  VirK protein  25.75 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1361  hypothetical protein  31.06 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000275115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04886  hypothetical protein  26.52 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0233  protein of unknown function DUF535  23.97 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1087  hypothetical protein  26.79 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0654  hypothetical protein  26.79 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1212  hypothetical protein  26.35 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>