283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4845 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4845  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 72 aa  147  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  98.53 
 
 		 214 aa  141  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  54.1 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 212 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 212 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  48.39 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  52 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  48.21 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  50 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  48 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 199 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  47.54 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
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NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  43.75 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 200 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  55.26 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 198 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  45.83 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 202 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 193 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 209 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 194 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
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NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  43.75 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 224 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 224 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 224 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 211 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
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