More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2248 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2248  DnaB family helicase  100 
 
 		 463 aa  950    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000601799  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1140  replicative DNA helicase  75.16 
 
 		 462 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0320772  hitchhiker  6.75353e-23 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2244  replicative DNA helicase  62.45 
 
 		 457 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0625  replicative DNA helicase  46.39 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.849454  hitchhiker  0.00500749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0385  replicative DNA helicase  45.95 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.139833  hitchhiker  0.000000000000128218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2920  replicative DNA helicase  45.1 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0425045  hitchhiker  0.00000000000000950507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  35.4 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  35.4 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  35.66 
 
 		 465 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  34.52 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  36.66 
 
 		 462 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2278  replicative DNA helicase  34.86 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467849  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  34.97 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  34.72 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4444  replicative DNA helicase  35.7 
 
 		 447 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  35.04 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  35.04 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  34.57 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  33.79 
 
 		 464 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58990  putative DNA helicase  34.99 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144919  normal  0.0290117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  34.42 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  34.11 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0931  replicative DNA helicase  33.69 
 
 		 470 aa  209  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000071326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  35.9 
 
 		 463 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  36.03 
 
 		 463 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  33.49 
 
 		 470 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  35.35 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4115  replicative DNA helicase  36.38 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0637  replicative DNA helicase  33.1 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0562  replicative DNA helicase  34.78 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.229469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  33.72 
 
 		 468 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  33.72 
 
 		 468 aa  206  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  31.98 
 
 		 478 aa  206  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  33.26 
 
 		 468 aa  206  8e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  33.26 
 
 		 468 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  33.72 
 
 		 468 aa  206  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  33.72 
 
 		 468 aa  206  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2068  DnaB helicase  34.85 
 
 		 466 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  33.26 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  34.66 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  33.1 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  33.1 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  33.1 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  34.82 
 
 		 472 aa  205  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  32.95 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  33.1 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  33.1 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0302  replicative DNA helicase  34.38 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  33.65 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  32.16 
 
 		 471 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  32.48 
 
 		 468 aa  204  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  32.16 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  32.16 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  31.92 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1531  DnaB helicase  34.12 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498152  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0357  replicative DNA helicase  34.56 
 
 		 465 aa  203  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.973101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  32.16 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  32.16 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  32.16 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  32.16 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  32.16 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  33.96 
 
 		 472 aa  203  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4407  replicative DNA helicase  32.79 
 
 		 440 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  32.9 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  32.44 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3611  replicative DNA helicase  32.55 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  33.92 
 
 		 460 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  33.92 
 
 		 460 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  32.48 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  32.87 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  31.84 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  33.42 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  33.33 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0905  replicative DNA helicase  31.57 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  31.77 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1459  replicative DNA helicase  32.72 
 
 		 467 aa  199  6e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  36.13 
 
 		 473 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  35.98 
 
 		 462 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  35.98 
 
 		 462 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  33.18 
 
 		 476 aa  199  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  33.64 
 
 		 468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  32.24 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  33.41 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  33.66 
 
 		 437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  32.24 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  32.24 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  36.13 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1358  replicative DNA helicase  33.97 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  32.24 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0959  primary replicative DNA helicase  32.49 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  35.9 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  32.79 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  35.66 
 
 		 461 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  32.06 
 
 		 468 aa  196  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  35.96 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  35.96 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  35.96 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  35.96 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  35.43 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  35.96 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>