15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2054 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01796  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1818  conserved hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1916  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000323077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2054  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1807  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207241  normal  0.322582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1362  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00025958  normal  0.014851 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2093  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2557  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000206935  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01784  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2395  hypothetical protein  74.47 
 
 
47 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0173642  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1979  hypothetical protein  87.23 
 
 
47 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0465232  normal  0.180554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2041  hypothetical protein  87.23 
 
 
47 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.012036  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1983  hypothetical protein  87.23 
 
 
47 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119473  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1291  hypothetical protein  87.23 
 
 
47 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000608947  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1475  hypothetical protein  85.11 
 
 
47 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000526472  normal  0.37018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>