91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3266 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00294  cyanate hydratase  100 
 
 
156 aa  312  9e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3266  cyanate lyase  100 
 
 
156 aa  312  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00298  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  312  9e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0365  cyanate hydratase  99.36 
 
 
156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.255513  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0371  cyanate hydratase  99.36 
 
 
156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0405  cyanate hydratase  98.72 
 
 
156 aa  309  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0413  cyanate hydratase  98.72 
 
 
156 aa  308  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3285  cyanate hydratase  98.72 
 
 
156 aa  307  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809741  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4127  cyanate hydratase  78.85 
 
 
156 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0840214 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3389  cyanate hydratase  78.85 
 
 
156 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.532373  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4778  cyanate hydratase  78.85 
 
 
156 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2815  cyanate hydratase  77.56 
 
 
156 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3092  cyanate hydratase  72.44 
 
 
156 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109616  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3236  cyanate hydratase  71.15 
 
 
156 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2147  cyanate hydratase  69.87 
 
 
156 aa  225  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1245  cyanate hydratase  68.59 
 
 
156 aa  224  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267707  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3321  cyanate hydratase  68.59 
 
 
156 aa  224  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3464  cyanate hydratase  68.59 
 
 
156 aa  225  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3427  cyanate hydratase  68.59 
 
 
156 aa  224  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0385  cyanate hydratase  68.59 
 
 
156 aa  224  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3463  cyanate hydratase  68.59 
 
 
156 aa  225  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2466  cyanate hydratase  68.59 
 
 
156 aa  224  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.773652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37965  cyanate hydratase  68.59 
 
 
156 aa  224  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000905925  normal  0.0242792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1533  cyanate hydratase  69.87 
 
 
156 aa  224  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243959  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1198  cyanate hydratase  68.59 
 
 
156 aa  222  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5946  cyanate hydratase  67.31 
 
 
156 aa  221  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.249052 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5702  cyanate hydratase  67.31 
 
 
156 aa  221  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.174504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3369  cyanate hydratase  63.87 
 
 
154 aa  204  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.792126  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3483  cyanate hydratase  62.82 
 
 
155 aa  202  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258814  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1930  cyanate lyase  60.9 
 
 
155 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.828935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4859  Cyanase  68.59 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1442  cyanate hydratase  46.58 
 
 
147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.905094  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2169  cyanate hydratase  47.26 
 
 
147 aa  147  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185897  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4911  cyanate hydratase  45.89 
 
 
147 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.278178  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3834  cyanate hydratase  45.89 
 
 
147 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1941  cyanate hydratase  47.48 
 
 
147 aa  140  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.711654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1335  cyanate hydratase  41.72 
 
 
147 aa  137  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3478  cyanate hydratase  39.73 
 
 
148 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3484  cyanate hydratase  43.15 
 
 
147 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0961  cyanate lyase  47.55 
 
 
148 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.357006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0731  cyanate hydratase  45.77 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.817256  normal  0.0248217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3739  cyanate hydratase  41.78 
 
 
147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0717  cyanate hydratase  45.77 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495999  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0547  cyanate hydratase  41.78 
 
 
147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0220  cyanate hydratase  40.41 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0289  cyanate hydratase  40.4 
 
 
147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0711  cyanate hydratase  46.67 
 
 
151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2755  cyanate hydratase  43.66 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.193973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3975  cyanate hydratase  41.06 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0303044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2824  cyanate hydratase  39.73 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100788 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0040  cyanate hydratase  43.84 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0467  cyanate hydratase  40.43 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0994  cyanate hydratase  39.04 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2287  cyanate hydratase  41.5 
 
 
146 aa  123  9e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14070  cyanate hydratase  47.45 
 
 
149 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.700662  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0013  cyanate hydratase  42.86 
 
 
156 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5864  cyanate hydratase  42.42 
 
 
133 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.847766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4912  cyanate hydratase  42.18 
 
 
149 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2659  cyanate hydratase  40.69 
 
 
144 aa  121  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0173685  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1997  cyanate hydratase  48.2 
 
 
149 aa  120  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2827  cyanate lyase  42.47 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2215  cyanate lyase  43.17 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0122067  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2586  cyanate hydratase  41.78 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3729  cyanate hydratase  39.04 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1707  cyanate hydratase  41.5 
 
 
162 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0867488  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0702  cyanate hydratase  38.78 
 
 
146 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.673515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3239  cyanate hydratase  37.67 
 
 
146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4815  cyanate hydratase  42.18 
 
 
162 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194691  decreased coverage  0.000076587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3015  cyanate hydratase  41.67 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208496  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02188  cyanate hydratase  52.04 
 
 
99 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00701  cyanate hydratase  43.57 
 
 
147 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.454831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4539  cyanate hydratase  40.82 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1390  cyanate hydratase  43.57 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2104  cyanate hydratase  42.36 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.852615  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1631  cyanate hydratase  39.46 
 
 
162 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2996  cyanate hydratase  39.31 
 
 
162 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0296  cyanate hydratase  40.28 
 
 
149 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.179303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2769  cyanate hydratase  39.31 
 
 
162 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2892  cyanate hydratase  38.62 
 
 
162 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1302  cyanate hydratase  40 
 
 
162 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2620  cyanate hydratase  38.62 
 
 
162 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2057  cyanate hydratase  36.73 
 
 
162 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5412  cyanate hydratase  36.73 
 
 
162 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232081  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0112  cyanate hydratase  38.1 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2406  cyanate hydratase  38.41 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109021  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07331  cyanate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16530)  42.52 
 
 
142 aa  91.7  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.723235 
 
 
-
 
NC_006686  CND04630  conserved hypothetical protein  33.73 
 
 
183 aa  90.9  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17187  predicted protein  36.5 
 
 
193 aa  88.6  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2054  cyanate hydratase  55.88 
 
 
80 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000429611  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02561  cyanate hydratase  51.79 
 
 
55 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02560  cyanate hydratase  35.71 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>