18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2104 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1699  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000300274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01511  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000394586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2157  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000031754  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01500  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000301119  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1624  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2117  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000221148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1750  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000198256  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2104  selenium-binding protein YdfZ  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.75874e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1621  putative selenium-binding protein YdfZ  79.1 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1680  putative selenium-binding protein YdfZ  79.1 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1612  putative selenium-binding protein YdfZ  79.1 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1662  putative selenium-binding protein YdfZ  79.1 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228802  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1828  hypothetical protein  79.1 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0391349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1936  putative cytoplasmic protein  71.64 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3174  selenium-binding protein YdfZ  42.42 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1731  hypothetical protein  39.39 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2840  hypothetical protein  39.39 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0277029  normal  0.114443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1623  hypothetical protein  39.39 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>