99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0013 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0013  putative oxidoreductase  100 
 
 		 354 aa  739    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03573  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  98.59 
 
 		 354 aa  731    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.360175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03517  hypothetical protein  98.59 
 
 		 354 aa  731    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.394006  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3902  putative oxidoreductase  97.46 
 
 		 366 aa  723    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4200  putative oxidoreductase  98.31 
 
 		 354 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0013  putative oxidoreductase  98.02 
 
 		 354 aa  729    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4056  putative oxidoreductase  97.18 
 
 		 361 aa  723    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5123  putative oxidoreductase  96.89 
 
 		 354 aa  718    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.121383 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3617  putative oxidoreductase  53.76 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0110465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0371  putative oxidoreductase  53.18 
 
 		 356 aa  391  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0282  putative oxidoreductase  50.43 
 
 		 353 aa  363  2e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  37.61 
 
 		 356 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  28.43 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  27.42 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  29.77 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  22.46 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.71 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.24 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 403 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 		 358 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  24.9 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  25.31 
 
 		 455 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  23.01 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.47 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  25.89 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  24.11 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  24.22 
 
 		 407 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 		 368 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  22.47 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  30.72 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.44 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.44 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.81 
 
 		 449 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.82 
 
 		 468 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  24.54 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  24.1 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  22.12 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  22.25 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  24.64 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.2 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  24.68 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  29.17 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.53 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  22.62 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.07 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  20.96 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  22.88 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  24.18 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.49 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  26.9 
 
 		 547 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 413 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5431  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.13 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.0291121 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  23.3 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.44 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  23.18 
 
 		 575 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5158  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  22.17 
 
 		 671 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0654699  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  22.44 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.02 
 
 		 509 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  28.14 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  24.15 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  23.58 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  28.12 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>