More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0420 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0420  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
109 aa  209  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.177045  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0601  50S ribosomal protein L24  88.99 
 
 
109 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.181696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  50.46 
 
 
105 aa  92  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  44.86 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 
104 aa  87.8  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
105 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 
105 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 
105 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  42.73 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
105 aa  84.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  39.45 
 
 
106 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
105 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
104 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
104 aa  84  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 
104 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
104 aa  84  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  42.59 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  46.73 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  42.99 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  41.82 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  42.59 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  42.99 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  42.59 
 
 
101 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  41.82 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0294  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000911949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  44.34 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3903  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000356583  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0594  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000014526  normal  0.407014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  40.91 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4306  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000126624  unclonable  0.0000000000482395 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  42.2 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  42.27 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  39.09 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4045  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000115284  unclonable  0.00000000000347385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0207  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0211  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000151512  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4159  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000135344  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  41.28 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  43.12 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4533  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114986  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  41.28 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0242  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  41.28 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0181  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000129578  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3748  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000844667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0210  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216375  unclonable  0.0000000000129617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0205  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  42.59 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0210  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4679  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000175822  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3990  50S ribosomal protein L24  42.73 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0024494  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  38.89 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3740  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000337214  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  45.87 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  40.74 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  40.74 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0404  ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002398  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  43.52 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3698  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000743122  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4632  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000390519  normal  0.45352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3694  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000331178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0404  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839278  hitchhiker  0.0000141467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3796  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3625  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00533524  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3733  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.012207  normal  0.015742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3503  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000502759  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3625  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000301612  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  42.31 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0416  50S ribosomal protein L24  43.64 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000325696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>