More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0089 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0054  L-glutamine synthetase  89.36 
 
 
490 aa  903    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0089  glutamine synthetase, type I  100 
 
 
470 aa  980    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  56.84 
 
 
469 aa  545  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  56.84 
 
 
469 aa  545  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  55.2 
 
 
469 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  55.77 
 
 
469 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  55.2 
 
 
469 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  54.03 
 
 
469 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  54.24 
 
 
469 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  55.13 
 
 
468 aa  528  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  53.5 
 
 
469 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  53.62 
 
 
469 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  54.03 
 
 
469 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  54.62 
 
 
469 aa  519  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2288  glutamine synthetase, type I  54.26 
 
 
469 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  53.94 
 
 
469 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  53.91 
 
 
469 aa  519  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  53.73 
 
 
473 aa  519  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  52.55 
 
 
469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3648  glutamine synthetase, type I  54.24 
 
 
469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  54.68 
 
 
469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  54.45 
 
 
469 aa  511  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3259  glutamine synthetase, type I  53.81 
 
 
469 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  54.58 
 
 
471 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  53.4 
 
 
469 aa  511  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  52.44 
 
 
470 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  53.6 
 
 
469 aa  512  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  53.38 
 
 
471 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  53.83 
 
 
469 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  53.62 
 
 
469 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  53.63 
 
 
469 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  53.62 
 
 
469 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  53.81 
 
 
469 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  52.54 
 
 
471 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2615  glutamine synthetase, type I  52.12 
 
 
471 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0119922  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  52.54 
 
 
471 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  52.26 
 
 
469 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  53.18 
 
 
469 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  53.83 
 
 
469 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  52.54 
 
 
471 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  52.98 
 
 
469 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  52.67 
 
 
469 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  52.47 
 
 
469 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  52.54 
 
 
471 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  52.75 
 
 
471 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  52.99 
 
 
469 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  52.9 
 
 
469 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  53.83 
 
 
469 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  52.54 
 
 
471 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  53.4 
 
 
469 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3916  glutamine synthetase  53.83 
 
 
469 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  52.97 
 
 
471 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  53.81 
 
 
469 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  52.54 
 
 
471 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  52.9 
 
 
469 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  52.54 
 
 
471 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  53.81 
 
 
469 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  51.69 
 
 
471 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  52.99 
 
 
471 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1481  glutamine synthetase, type I  52.11 
 
 
471 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494323  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  54.04 
 
 
469 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  51.38 
 
 
470 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1522  L-glutamine synthetase  51.91 
 
 
471 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000686427  normal  0.138561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  51.91 
 
 
471 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  53.39 
 
 
469 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  51.69 
 
 
471 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3416  glutamine synthetase  52.55 
 
 
469 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  53.39 
 
 
469 aa  504  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  51.69 
 
 
471 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  52.97 
 
 
469 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3554  glutamine synthetase  52.77 
 
 
469 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4643  glutamine synthetase  53.4 
 
 
469 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  51.48 
 
 
471 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  52.75 
 
 
469 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  53.39 
 
 
469 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  51.69 
 
 
471 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  51.69 
 
 
471 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  53.39 
 
 
469 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1582  glutamine synthetase, type I  52.32 
 
 
471 aa  499  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  53.16 
 
 
471 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  52.35 
 
 
486 aa  501  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0769  glutamine synthetase, type I  53.86 
 
 
467 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0292  glutamine synthetase  52.13 
 
 
469 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000978153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4503  glutamine synthetase  52.97 
 
 
469 aa  500  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664136  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  52.33 
 
 
471 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  53.53 
 
 
470 aa  500  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  52.45 
 
 
477 aa  500  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  52.33 
 
 
471 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>