12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0057 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0029  hypothetical protein  94.36 
 
 
750 bp  890    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0057    100 
 
 
612 bp  1213    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000674339  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0064    98.02 
 
 
468 bp  460  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830805  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0061  hypothetical protein  96.23 
 
 
258 bp  178  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.140648 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0050    96.49 
 
 
459 bp  97.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.225945  normal  0.017537 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0060    95.35 
 
 
285 bp  69.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.768323  hitchhiker  0.00000864277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5002  hypothetical protein  97.06 
 
 
1653 bp  60  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2784  hypothetical protein  100 
 
 
1650 bp  56  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  92.11 
 
 
2776 bp  52  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01540  hypothetical protein  100 
 
 
1789 bp  52  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32956  predicted protein  100 
 
 
1278 bp  52  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0445544  normal  0.24462 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05597  ubiquinol-cytochrome c reductase complex 17 kd protein (AFU_orthologue; AFUA_4G11390)  100 
 
 
1511 bp  50.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>