19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5041 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5041  IS66 family element, orf1  100 
 
 
53 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1310  IS66 family element, orf1  100 
 
 
53 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1181  IS66 family element, orf1  100 
 
 
53 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  98.11 
 
 
133 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  98.11 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  96.23 
 
 
133 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>