73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4150 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4150  EivF  100 
 
 		 249 aa  510  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0288495 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3021  invasion protein  38.27 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3104  invasion protein  37.45 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000120777 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3209  invasion protein  37.45 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3052  invasion protein  37.45 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.227762 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3089  invasion protein  37.45 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2176  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2088  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0587  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  34.29 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0000113991  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2059  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  34.29 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0739  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  34.29 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480247  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1545  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  34.29 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0827  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  33.01 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781437  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0178  transcriptional regulator MxiE  37.82 
 
 		 210 aa  95.9  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0571394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 299 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.52 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  30.65 
 
 		 301 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 154 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 301 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 299 aa  45.4  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5999  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1945  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  29.9 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 385 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 		 331 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1788  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 350 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432014  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36360  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 309 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 320 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1936  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.59 
 
 		 188 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 329 aa  42.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 382 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 285 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0345  helix-turn-helix domain-containing protein  28.95 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 305 aa  42  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 361 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 301 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.57 
 
 		 318 aa  42  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>