135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4123 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0836  transcriptional regulator, CadC  96.72 
 
 		 458 aa  913    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4123  transcriptional regulator  100 
 
 		 458 aa  946    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3000  transcriptional regulator  96.72 
 
 		 458 aa  913    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000507386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3173  transcriptional regulator  96.72 
 
 		 458 aa  913    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0862  transcriptional regulator  96.72 
 
 		 458 aa  913    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  33.33 
 
 		 565 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3029  invasion protein regulator  29.78 
 
 		 553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0229765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3186  invasion protein regulator  29.78 
 
 		 555 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.735415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3065  invasion protein regulator  29.78 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.359189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3081  invasion protein regulator  29.78 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2998  invasion protein regulator  29.78 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000362876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  24.26 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  21.97 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  21.41 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  24.07 
 
 		 521 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5304  transcriptional regulator, CadC  36.27 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  21.53 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  33.73 
 
 		 977 aa  57  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  38.67 
 
 		 756 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  31.25 
 
 		 711 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  29.63 
 
 		 584 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 1092 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3384  transcriptional regulator, CadC  33.68 
 
 		 693 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02602  transcriptional regulatory protein, C terminal  29.46 
 
 		 772 aa  53.9  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  20.32 
 
 		 522 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  38.46 
 
 		 762 aa  53.9  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  33.33 
 
 		 531 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3319  transcriptional regulatory protein-like protein  31.58 
 
 		 691 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.389048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  31.63 
 
 		 717 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 901 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 1020 aa  50.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  21.13 
 
 		 510 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6027  transcriptional regulator, CadC  28.12 
 
 		 188 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0284754  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1080 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 712 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1075 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  25.81 
 
 		 527 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 1063 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 1075 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  30.49 
 
 		 224 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2919  transcriptional regulatory protein-like protein  31.82 
 
 		 604 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  35.71 
 
 		 774 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  31.63 
 
 		 229 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  29.89 
 
 		 711 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  34.44 
 
 		 520 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  30.77 
 
 		 396 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0563  transcriptional regulatory protein-like protein  28.57 
 
 		 678 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 237 aa  47.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2494  DNA-binding transcriptional activator CadC  28.24 
 
 		 542 aa  47.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  29.29 
 
 		 504 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3088  transcriptional regulator, CadC  29.67 
 
 		 574 aa  47  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1241  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  28.99 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0151467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  29.67 
 
 		 396 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2656  DNA-binding transcriptional activator CadC  27.73 
 
 		 541 aa  47  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0682  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0697  response regulator receiver  32.14 
 
 		 224 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.156095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  32.98 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 928 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3304  transcriptional regulatory protein-like protein  33.33 
 
 		 580 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.87 
 
 		 231 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  34.29 
 
 		 1102 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0847  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  32 
 
 		 700 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.704427  normal  0.802494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3629  putative transcriptional regulator, CadC  31.65 
 
 		 501 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.375084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1009  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0833578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  30.84 
 
 		 945 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2883  transcriptional regulator domain-containing protein  37.08 
 
 		 716 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.011265  hitchhiker  0.0000000742237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2965  transcriptional regulator domain-containing protein  37.08 
 
 		 716 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00199161  normal  0.0124128 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  30.86 
 
 		 229 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02470  hypothetical protein  36.25 
 
 		 250 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  29.03 
 
 		 229 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 222 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  29.79 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  29.79 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 222 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  29.63 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  30.14 
 
 		 233 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0109  response regulator receiver  30.49 
 
 		 225 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000662688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  28.92 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  29.79 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  29.79 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  29.79 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  29.79 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  29.79 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  31.18 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 224 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  29.79 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  29.79 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  29.79 
 
 		 229 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  30.77 
 
 		 229 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  32.1 
 
 		 1092 aa  44.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0798  two component transcriptional regulator  32.05 
 
 		 220 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 256 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>