152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4114 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02693  predicted transporter  100 
 
 
409 aa  820    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02656  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  820    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0845  serine transporter  100 
 
 
409 aa  820    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3240  inner membrane transport protein YqeG  89.95 
 
 
409 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3302  spore germination protein  84.77 
 
 
409 aa  715    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3356  inner membrane transport protein YqeG  90.2 
 
 
409 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2992  serine transporter family protein  100 
 
 
409 aa  820    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000482525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4114  serine transporter family protein  100 
 
 
409 aa  820    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104615 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3167  serine transporter family protein  100 
 
 
409 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3175  inner membrane transport protein YqeG  90.2 
 
 
409 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3191  inner membrane transport protein YqeG  89.73 
 
 
409 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0870  serine transporter  100 
 
 
409 aa  820    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2993  serine transporter family protein  100 
 
 
409 aa  820    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.07384 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3015  serine transporter family protein  99.76 
 
 
409 aa  818    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3254  inner membrane transport protein YqeG  90.2 
 
 
409 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0329788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2139  serine transporter  41.36 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.41295  normal  0.95428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1339  serine transporter  38.26 
 
 
429 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2939  serine transporter  38.5 
 
 
429 aa  293  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.557142  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3113  serine transporter family protein  40.14 
 
 
429 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3178  serine transporter family protein  40.14 
 
 
429 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.509174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3293  serine transporter family protein  40.14 
 
 
429 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.412902  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3130  serine transporter family protein  40.14 
 
 
429 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805755  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3193  serine transporter family protein  40.14 
 
 
429 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472945  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2656  serine transporter  37.83 
 
 
433 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2739  serine transporter  37.83 
 
 
433 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1630  serine transporter  37.32 
 
 
431 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.80045  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1550  serine transporter  37.59 
 
 
440 aa  289  6e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3396  aromatic amino acid permease  38.48 
 
 
426 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3101  serine transporter family protein  38.5 
 
 
429 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.41481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02641  predicted serine transporter  38.5 
 
 
429 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0892  serine transporter  38.5 
 
 
429 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2940  serine transporter family protein  38.5 
 
 
429 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.271081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02603  hypothetical protein  38.5 
 
 
429 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4060  serine transporter family protein  38.5 
 
 
429 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0533017  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2936  serine transporter family protein  38.5 
 
 
429 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0834253  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0916  serine transporter  38.26 
 
 
429 aa  285  7e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2241  hypothetical protein  37.96 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2269  hypothetical protein  37.96 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3076  serine transporter family protein  38.26 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.119779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2666  serine transporter  37.29 
 
 
427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.973532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1242  serine transporter  37.1 
 
 
427 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0363509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3249  serine transporter  38.98 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416009  normal  0.367748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2804  amino acid transporter transmembrane  38.7 
 
 
425 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2327  aromatic amino acid permease  37.66 
 
 
426 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2183  aromatic amino acid permease  37.4 
 
 
426 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2397  putative serine transporter  36.1 
 
 
430 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3589  aromatic amino acid ABC transporter permease  37.14 
 
 
426 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0919  serine transporter  36.92 
 
 
433 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3149  putative serine transporter  36.83 
 
 
430 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3633  threonine/serine transporter  36.25 
 
 
425 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0863  aromatic amino acid permease  36.59 
 
 
423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0858  aromatic amino acid permease  36.5 
 
 
423 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0739  aromatic amino acid permease  36.21 
 
 
423 aa  257  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1760  threonine/serine transporter  35.37 
 
 
425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05580  hypothetical protein  36.34 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2772  amino acid transporter, transmembrane  36.03 
 
 
438 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3286  serine/threonine transporter family protein  36.19 
 
 
439 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3066  serine/threonine transporter family protein  35.94 
 
 
439 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3306  serine/threonine transporter family protein  35.94 
 
 
439 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243696  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001600  serine transporter  37.07 
 
 
418 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3207  serine/threonine transporter family protein  35.94 
 
 
439 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5569  aromatic amino acid permease  36.54 
 
 
439 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.179015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2484  serine/threonine transporter family protein  35.8 
 
 
439 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3262  amino acid transporter, transmembrane  35.78 
 
 
430 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0761  amino acid transporter, transmembrane  35.54 
 
 
430 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3552  aromatic amino acid permease  35.05 
 
 
431 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3674  aromatic amino acid permease  35.05 
 
 
431 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0765  aromatic amino acid permease  35.05 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3483  aromatic amino acid permease  35.05 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3146  aromatic amino acid permease  36.43 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3177  serine transporter  35.94 
 
 
439 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0861  aromatic amino acid permease  34.62 
 
 
431 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3416  serine transporter  36.05 
 
 
439 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3365  serine transporter, putative  35.05 
 
 
430 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3415  serine/threonine transporter family protein  35.94 
 
 
439 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0919  serine transporter, putative  34.56 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1840  serine/threonine transporter family protein  36.74 
 
 
439 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.781271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3407  serine/threonine transporter family protein  36.74 
 
 
439 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3427  serine/threonine transporter family protein  36.74 
 
 
439 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3106  serine transporter  36.74 
 
 
439 aa  239  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3198  serine/threonine transporter family protein  36.74 
 
 
439 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0885914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3451  serine/threonine transporter family protein  36.74 
 
 
439 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.305913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1262  serine transporter  35.77 
 
 
417 aa  237  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.040396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0688  aromatic amino acid permease  37.19 
 
 
419 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0771  aromatic amino acid permease  33.33 
 
 
428 aa  230  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2127  serine transporter, putative  34.02 
 
 
453 aa  229  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0423  serine transporter  34.1 
 
 
413 aa  228  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003156  serine transporter  33.9 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01909  hypothetical protein  33.91 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0919  serine transporter  33.17 
 
 
417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110337  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1344  serine transporter  33.51 
 
 
416 aa  219  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1616  serine transporter  35.7 
 
 
416 aa  216  7e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.973383  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1985  serine transporter  31.09 
 
 
440 aa  215  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1797  serine transporter  35.61 
 
 
416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0084  L-serine transporter  30.28 
 
 
440 aa  209  9e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0882  serine transporter  32.2 
 
 
413 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3434  threonine/serine transporter TdcC  31.06 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3538  threonine/serine transporter TdcC  31.06 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.457036  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3431  threonine/serine transporter TdcC  31.06 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3601  threonine/serine transporter TdcC  31.06 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>