36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3852 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  98.88 
 
 		 1242 bp  1017    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02501  predicted inner membrane protein  98.7 
 
 		 1197 bp  1009    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  98.51 
 
 		 1263 bp  1001    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  98.7 
 
 		 1263 bp  1009    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  98.7 
 
 		 1242 bp  1009    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  94.79 
 
 		 1263 bp  842    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  98.51 
 
 		 1263 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3852    100 
 
 		 537 bp  1065    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000447837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02465  hypothetical protein  98.7 
 
 		 1197 bp  1009    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000805698  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  85.85 
 
 		 1242 bp  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  85.85 
 
 		 1242 bp  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  85.66 
 
 		 1242 bp  454  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  85.29 
 
 		 1242 bp  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  84.73 
 
 		 1242 bp  414  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  80.69 
 
 		 1242 bp  234  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  82.31 
 
 		 1290 bp  151  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  79.9 
 
 		 1284 bp  79.8  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0889  inner membrane protein YfjD  79.9 
 
 		 597 bp  79.8  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0134966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  79.9 
 
 		 1257 bp  79.8  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  88.89 
 
 		 1308 bp  79.8  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  86.76 
 
 		 1275 bp  63.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  86.76 
 
 		 1275 bp  63.9  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3851    100 
 
 		 756 bp  61.9  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000682512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  84.62 
 
 		 1281 bp  60  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  86.15 
 
 		 1308 bp  58  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  94.59 
 
 		 1275 bp  58  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  86.15 
 
 		 1308 bp  58  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  85.29 
 
 		 1275 bp  56  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  85.94 
 
 		 1284 bp  56  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  96.77 
 
 		 876 bp  54  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  86.44 
 
 		 1275 bp  54  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  92.11 
 
 		 1272 bp  52  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2951  CBS domain containing protein  96.55 
 
 		 870 bp  50.1  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  96.43 
 
 		 1263 bp  48.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  91.43 
 
 		 1272 bp  46.1  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  93.55 
 
 		 1332 bp  46.1  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>