More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3636 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2675  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000585827  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2676  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00067711  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3636  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130936  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4683  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.66609e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2781  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000634028  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3635  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149841  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2651  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000523066  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2556  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000389314  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2555  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000393303  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2609  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000718351  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2652  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000608087  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4682  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.8092300000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2610  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000740519  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4656  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.90971e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2560  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000861237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2837  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.88964e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2966  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.55159e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2561  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777875  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0584  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.67929e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00016  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000202389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00018  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000172255  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00041  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000120834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00042  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000123332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00043  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000135072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0032  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0033  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139547  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0034  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000138641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0057  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0059  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  6.36722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0911  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000875601  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0072  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560906  normal  0.267671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2780  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000064612  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0879  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000126601  normal  0.645347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0038  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0035  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.134174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0070  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000583072  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2554  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138872  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2559  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0847  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000806074  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0788  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000010379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0040  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.37515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0054  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.444968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0052  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0059  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00482494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0037  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.140451  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0058  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00534355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0849  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000146237  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0769  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000076951  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0039  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  hitchhiker  0.00359795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0038  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000627564  hitchhiker  0.00122334 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0815  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000696983  normal  0.877811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2608  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000643017  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2967  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.52961e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0767  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000989037  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0039  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2650  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000507401  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3634  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000679496  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0060  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00525968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0036  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.132949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0053  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4681  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.95676e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5049  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5051  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000673895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5050  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5021  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4658  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.127679999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2674  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00824453  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0037  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000578787  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0665  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000217876  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2782  tRNA-Val  98.72 
 
 
78 bp  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000628066  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0848  tRNA-Val  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000265461  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0457  tRNA-Val  100 
 
 
73 bp  139  1e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t48  tRNA-Val  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t50  tRNA-Val  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.220633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA26  tRNA-Val  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.241705  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA28  tRNA-Val  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000265839  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1859  tRNA-Val  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00131515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2039  tRNA-Val  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21800  tRNA-Val  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000344548  normal  0.0953285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24110  tRNA-Val  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000487057  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0097  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5687  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000478099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5732  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-2  tRNA-Val  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-3  tRNA-Val  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-4  tRNA-Val  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000645962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-5  tRNA-Val  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000098013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0018  tRNA-Val  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179494 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-1  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-2  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000053562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-3  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-4  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-6  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0036  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0018  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.010388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0080  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000518886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0036  tRNA-Val  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0045  tRNA-Val  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0053  tRNA-Val  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0038  tRNA-Val  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>