16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3564 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_10013  bet  99.62 
 
 		 261 aa  544  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0805  phage recombination protein Bet  99.62 
 
 		 261 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3241  phage recombination protein Bet  99.62 
 
 		 261 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  hitchhiker  0.00000845343 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3564  phage recombination protein Bet  100 
 
 		 261 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0102109  hitchhiker  5.30303e-19 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00713  hypothetical protein  99.62 
 
 		 261 aa  544  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2876  phage recombination protein Bet  99.23 
 
 		 261 aa  540  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00954022  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2931  phage recombination protein Bet  99.23 
 
 		 261 aa  542  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321205  decreased coverage  3.3595200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1112  recombination protein bet  95.75 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.104209  normal  0.366414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0884  recombination protein bet  99.07 
 
 		 215 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0109  phage recombination protein Bet  54.36 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237618 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2377  phage recombination protein Bet, putative  47.93 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00019596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  47.06 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  0.0000388428 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0056  phage recombination protein Bet  27.67 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00827419  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0851  putative prophage LambdaCh01, recombination protein Bet  26.4 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000847263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1883  phage recombination protein Bet  28.57 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02960  phage recombination protein Bet  25.75 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000371623  hitchhiker  1.14884e-46 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>