15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2389 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01644  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000851882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1967  conserved hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000722627  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1756  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.6348e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1891  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000141261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1956  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000108793  unclonable  0.00000000811136 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01634  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000911853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1521  hypothetical protein  100 
 
 
56 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000100099  hitchhiker  0.0000000156844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2389  hypothetical protein  100 
 
 
56 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000187049  hitchhiker  0.0000552935 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1876  hypothetical protein  98.21 
 
 
69 aa  110  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000551628  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1501  hypothetical protein  91.07 
 
 
70 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000274817 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1522  hypothetical protein  91.07 
 
 
70 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1485  hypothetical protein  91.07 
 
 
70 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.657816  normal  0.304903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1783  hypothetical protein  91.07 
 
 
70 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.695382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1954  hypothetical protein  91.07 
 
 
70 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1774  hypothetical protein  87.04 
 
 
69 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>