15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2290 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2290  putative transposase  100 
 
 		 68 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.417357  hitchhiker  0.0000000000265233 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  93.94 
 
 		 398 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  93.94 
 
 		 426 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  93.94 
 
 		 431 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  57.58 
 
 		 428 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  51.52 
 
 		 430 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  51.52 
 
 		 446 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  51.52 
 
 		 446 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  51.72 
 
 		 428 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  47.54 
 
 		 412 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  36.51 
 
 		 411 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  36.51 
 
 		 411 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  36.51 
 
 		 411 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  39.68 
 
 		 255 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  33.9 
 
 		 411 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>