130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03994 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03994  C4-dicarboxylate antiporter  100 
 
 		 446 aa  890    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3869  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  100 
 
 		 446 aa  890    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2701  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  89.66 
 
 		 453 aa  754    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1406  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  88.34 
 
 		 446 aa  745    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5637  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 		 446 aa  890    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.363668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 		 446 aa  890    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03955  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  890    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.905652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1813  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  87.67 
 
 		 446 aa  739    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3863  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  89.91 
 
 		 446 aa  749    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3904  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 		 446 aa  890    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4589  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 		 446 aa  890    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4647  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  97.76 
 
 		 446 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4647  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  97.76 
 
 		 446 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4556  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  97.76 
 
 		 446 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4565  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  97.76 
 
 		 446 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4696  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  97.53 
 
 		 446 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3576  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  73.08 
 
 		 446 aa  615  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0772  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  69.1 
 
 		 474 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0697  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  69.31 
 
 		 474 aa  609  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0561  C4-dicarboxylate transporter, anaerobic  66.59 
 
 		 442 aa  587  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2479  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.19 
 
 		 447 aa  488  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0307  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.23 
 
 		 447 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0302  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.23 
 
 		 447 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0298  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.23 
 
 		 447 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3222  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.85 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0303  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.23 
 
 		 447 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4417  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.23 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  54.77 
 
 		 447 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.4 
 
 		 447 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  54.77 
 
 		 447 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600202 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  54.55 
 
 		 447 aa  472  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012855 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000075  C4-dicarboxylate like transporter  47.15 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.834607  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2500  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.59 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1023  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.68 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05690  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.01 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1566  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.69 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1800  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.6 
 
 		 447 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.6 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4182  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.12 
 
 		 441 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.877677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2751  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.67 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3540  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.87 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000247021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3993  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.58 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000171498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0685  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.78 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1304  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.54 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000133068 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3841  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.64 
 
 		 438 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2921  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.77 
 
 		 443 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2120  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.29 
 
 		 441 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1173  anaerobic C4-dicarboxylate membrane transporter  70.37 
 
 		 555 aa  365  1e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0146  anaerobic C4-dicarboxylate membrane transporter  73.13 
 
 		 557 aa  355  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2657  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  41.4 
 
 		 433 aa  342  7e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000544517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3278  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  42.21 
 
 		 443 aa  342  8e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.737723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3845  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  40.55 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1721  FUR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 558 aa  334  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2084  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.44 
 
 		 453 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1000  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  63.02 
 
 		 559 aa  331  2e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.921099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1756  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.22 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2178  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.22 
 
 		 453 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0351  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.54 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1605  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  39.27 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0366  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.08 
 
 		 437 aa  322  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0488  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.31 
 
 		 437 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0441  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.31 
 
 		 437 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.31 
 
 		 437 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0354  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.31 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0378  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.31 
 
 		 437 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0421  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.54 
 
 		 437 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4883  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.08 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0489  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.08 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.06 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0158  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.53 
 
 		 436 aa  318  9e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1227  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.86 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0182987  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0240  hypothetical protein  38.37 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2007  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  38.5 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3974  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.78 
 
 		 439 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3913  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.2 
 
 		 439 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.689386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0588  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.64 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3408  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.91 
 
 		 433 aa  294  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3871  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.65 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3793  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.98 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3805  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.98 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3893  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  37.13 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3533  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.27 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0325  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.53 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0505  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.18 
 
 		 433 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3854  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  36.49 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04008  C4-dicarboxylate antiporter  36.49 
 
 		 433 aa  267  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5654  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.49 
 
 		 433 aa  267  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00371648  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4379  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.49 
 
 		 433 aa  267  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3874  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.49 
 
 		 433 aa  267  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03970  hypothetical protein  36.49 
 
 		 433 aa  267  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4607  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.49 
 
 		 433 aa  267  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.104112  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4667  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.49 
 
 		 433 aa  267  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0724  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.07 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4693  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.49 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1121  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1556  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  34.72 
 
 		 497 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678975  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4743  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.94 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.722845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4595  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.94 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4603  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.94 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4721  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.94 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0855825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>